REAXYS數(shù)據(jù)庫-中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)生命科學(xué)實驗中心.ppt

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1、,,,,,,Reaxys數(shù)據(jù)庫,產(chǎn)品技術(shù)專家 高輝,提綱,,Elsevier公司介紹 Reaxys介紹 Reaxys使用 Reaxys檢索條件,檢索結(jié)果導(dǎo)出與保存 如何Create Alert Q&A及其現(xiàn)場演示,,Elsevier公司簡介,Elsevier(愛思唯爾),,Elsevier是一家經(jīng)營科學(xué)、技術(shù)和醫(yī)學(xué)信息產(chǎn)品及出版服務(wù)的世界三大出版集團之一,其出版歷史可追溯至1880年 遍布25個國家的74個分支機構(gòu)和7,500 名員工 每年出版2000多種期刊和1900種新書 ,領(lǐng)域涵蓋醫(yī)學(xué)、生命科學(xué)、自然科學(xué)和社會科學(xué)等占全球科技期刊的25% 180個國家,3000萬科研人員必不可少的科技信

2、息資源,,全球最全面的科學(xué)期刊和在線期刊與科學(xué)數(shù)據(jù)服務(wù)商, 主要產(chǎn)品有: Scopus 全球最大的文摘與引文數(shù)據(jù)庫 ScienceDirect 全球最大的外文期刊全文數(shù)據(jù)庫 CrossFire:Beilstein全球最全的有機化學(xué)數(shù)值和事實庫 Patent Chemistry化學(xué)專利數(shù)據(jù)庫 Gmelin當(dāng)今最全面的無機與金屬有機化學(xué)事實數(shù)據(jù)庫 Reaxys Crossfire的升級產(chǎn)品 PharmaPendium 綜合性藥物安全性數(shù)據(jù)的關(guān)鍵來源,,Reaxys 發(fā)展歷史介紹,CrossFire 1.0 Structures&Facts,,1817,1881,1988,198

3、9,1993,1996,2007,Gmelin Handbook,Beilstein Handbook,CrossFire Commander V3.2 plusReactions,CrossFire Commander V7.1,January 1st 2009: Reaxys 1.0,Beilstein on STN,Reaxys的發(fā)展歷程,,Reaxys的內(nèi)容,豐富的內(nèi)容,全面的高質(zhì)量的數(shù)值與事實數(shù)據(jù)庫,Reaxys,Patent,Beilstein,Gmelin,,,,,,,2800萬反應(yīng) 1800萬物質(zhì) 400萬文獻,,CrossFire Beilstein Database :世界

4、最全的有機化學(xué)數(shù)值和事實庫 時間跨度從1771年至今 化學(xué)結(jié)構(gòu)相關(guān)的化學(xué)、物理等方面的性質(zhì) 化學(xué)反應(yīng)相關(guān)的各種數(shù)據(jù) 詳細(xì)的藥理學(xué),環(huán)境病毒學(xué),生態(tài)學(xué)等信息資源 Patent Chemistry Database: Beilstein的完美補充 涵蓋的國際專利類別IPC(1976年之后) C07 有機化學(xué) A61K 藥物(醫(yī)藥,牙醫(yī),化妝品制備) A01N 生物殺滅劑(農(nóng)用化學(xué)品,消毒劑等) C09B

5、 染料(可能具有藥理學(xué)活性),Crossfire簡介,CrossFire Gmelin Database:全面的無機化學(xué)和金屬有機化學(xué)數(shù)值和事實庫 1772年至今,3個月更新一次 詳細(xì)的理化性質(zhì)、地質(zhì)學(xué),礦物學(xué),冶金學(xué),材料學(xué)等方面的信息資源,Crossfire Gmelin 簡介,,Reaxys是什么?,Reaxys的優(yōu)點:,Reaxys不需要要安裝客戶端軟件,使用方便; Reaxys功能不僅強大,而且使用界面也符合大眾使用習(xí)慣,容易上手 Reaxys 將Beilstein/Patent/Gmelin三個數(shù)據(jù)庫整合為一個 Reaxys 能把檢索結(jié)果按照收率、催化劑等條件進行二次過濾 Reax

6、ys 還能自動生成一條合成路線就好了.,,Reaxys對電腦軟硬件要求,Reaxys登陸界面,,網(wǎng)址:,IP綁定模式,,用戶注冊并登陸,,選擇畫圖軟件,,,,,,在Reaxys中注冊用戶,使用注冊的用戶進行登陸,進入“My Settings”,進入“Modify Application Settings”,下載并安裝 “Reaxys Structure Editor Plugin”,在電腦中安裝需要的畫圖軟件,如ISIS Draw或Symyx Draw,選擇需要的畫圖軟件, 如ISIS Draw或Symyx Draw,點擊“Save”進行保存設(shè)置,在Reaxys中注冊用戶和選擇畫圖軟件的操作流

7、程,,,,,,,,,Reaxys的檢索界面化學(xué)反應(yīng),,,,結(jié)構(gòu)式和 化學(xué)反應(yīng) 輸入?yún)^(qū)域,,,,,Reaxys的檢索界面化學(xué)物質(zhì),,,結(jié)構(gòu)式 輸入?yún)^(qū)域,,,Reaxys的檢索界面文獻,,,,,,,Reaxys 的檢索,一、關(guān)鍵字檢索 二、結(jié)構(gòu)式檢索 三、 聯(lián)合檢索(關(guān)鍵字與結(jié)構(gòu)式) 四、二次篩選的靈活應(yīng)用 五、 合成路線的智能設(shè)計,Reaxys的檢索方式,,,例: 檢索CAS號為34014-18-1 的化合物,,,,檢索結(jié)果顯示,檢索結(jié)果顯示,,,檢索結(jié)果顯示,,,例2: 檢索包含特定信息的文獻,檢索結(jié)果顯示,,,,,,ScienceDirect:全學(xué)科的全文數(shù)據(jù)庫,得到130多個國家認(rèn)可,中國

8、用量最高的外文期刊數(shù)據(jù)庫。,一、關(guān)鍵字檢索 二、結(jié)構(gòu)式檢索 三、 聯(lián)合檢索(關(guān)鍵字與結(jié)構(gòu)式) 四、二次篩選的應(yīng)用 五、 合成路線的智能設(shè)計,Reaxys的檢索方式,,二、結(jié)構(gòu)式檢索,1、精確結(jié)構(gòu)檢索 2、子結(jié)構(gòu)檢索 3、化學(xué)反應(yīng)檢索,,,,一、精確結(jié)構(gòu)式檢索,,檢索結(jié)果顯示,,,,,,,2、子結(jié)構(gòu)檢索,,輸入一個基本結(jié)構(gòu),我們可以查詢包含這個分子骨架的所有化學(xué)結(jié)構(gòu)。,,,,,,,,子結(jié)構(gòu)查詢2:不定位的R取代基的查詢,查詢只含有一個乙酸基團的所有苯胺,,,,不定位的R取代基的查詢結(jié)果(Table),,,,不定位的R取代基的查詢結(jié)果(Grid),,,,,,,,,,,子結(jié)構(gòu)查詢3:Atom lis

9、t 查詢,,,3、化學(xué)反應(yīng)檢索:例一,,查詢一條如圖所示的反應(yīng),,,,,,當(dāng)然,半反應(yīng)查詢也是很好的一個查詢方式,,,例: 查詢鄰位C上連接一個芳基和一個鏈狀烷烴的羧基還原為醇羥基的反應(yīng),化學(xué)反應(yīng)檢索,例二Reaxys :廣義集團的定義,,,Reaxys廣義集團選擇框,,,,直鏈烷烴,代表不包括氫的芳環(huán),,,,,直鏈烷烴,,,代表不包括氫的芳環(huán),,,去掉使用毒性較大溶劑的相關(guān)文獻,,選擇比較可信的期刊,,,,數(shù)量減為42個,,,,,產(chǎn)率最好要高點,,,,,,這次應(yīng)該差不多了,一、關(guān)鍵字檢索 二、結(jié)構(gòu)式檢索 三、 聯(lián)合檢索(關(guān)鍵字與結(jié)構(gòu)式) 四、二次篩選的應(yīng)用 五、 合成路線的智能設(shè)計,Reax

10、ys的檢索方式,,,,這里只選擇了編號為1,3,5三條記錄作為選擇的記錄,,,一、關(guān)鍵字檢索 二、結(jié)構(gòu)式檢索 三、 聯(lián)合檢索(關(guān)鍵字與結(jié)構(gòu)式) 四、二次篩選的應(yīng)用 五、 合成路線的智能設(shè)計,Reaxys的檢索方式,,四、二次篩選功能,第一次檢索結(jié)果較多,想直接篩選出符合自己需要的檢索條目 或者有些檢索記錄是不需要的,需要從檢索條目中去除 避免檢索時檢索條件太嚴(yán)格漏掉有用信息 二次篩選功能是快速,高效檢索文獻的利器,,二次檢索的分類類型,全部在左側(cè)列出,,,,,,,展開后的二次檢索欄目,已經(jīng)自動分類,,,,,,還可以通過人工選擇進行過濾,,通過點擊方框回到之前查詢結(jié)果中,再次進行不同條件篩選,,

11、以各種Filter條件可以連續(xù)進行二次篩選,,一、關(guān)鍵字檢索 二、結(jié)構(gòu)式檢索 三、 聯(lián)合檢索(關(guān)鍵字與結(jié)構(gòu)式) 四、二次篩選的應(yīng)用 五、 合成路線的智能設(shè)計,Reaxys的檢索方式,,五、反應(yīng)路線設(shè)計,,Gefitinib(吉非替尼,商品名:易瑞沙):第一個批準(zhǔn)上市治療非小細(xì)胞肺癌的EGFR抑制劑,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,Reaxys檢索結(jié)果導(dǎo)出與保存,Reaxys檢索結(jié)果導(dǎo)出與保存,,,,,要是選擇導(dǎo)出全部數(shù)據(jù),由于數(shù)據(jù)太多,會慢很多。 可以選擇只導(dǎo)出自己需要的數(shù)據(jù),,Reaxys檢索結(jié)果導(dǎo)出與保存,,Reaxys檢索條件本地保存,,,,Reaxys檢索結(jié)果在線保存,,,,,,Reaxys檢索結(jié)果在線保存,Reaxys檢索結(jié)果在線保存,,,,,,如何Create Alert,Create Alert,,,,Create Alert,,,,Create Alert,,,總 結(jié),信息量:Reaxys數(shù)據(jù)庫含有豐富數(shù)據(jù)量,涵蓋了有機化學(xué),生物醫(yī)藥以及相關(guān)專利等方面最主要的、最新的研究內(nèi)容。 檢索功能: Reaxys提供了各種先進高效的檢索方法與二次篩選的功能綜合應(yīng)用,可以幫助用戶快速從海量的數(shù)據(jù)中找出所需要的信息。 界面:十分友好,易于操作,瀏覽方便。 檢索結(jié)果的處理:得到了很大程度的簡化,可以十分方便的導(dǎo)出數(shù)據(jù)并生成報告。,,感謝各位的參與和支持 高輝 ,,

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