中山大學醫(yī)學圖書館數(shù)據(jù)庫檢索指南.doc

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中山大學醫(yī)學圖書館數(shù)據(jù)庫檢索指南 Sun Yat-sen University Library Guide SciFinder Scholar (CA) 化學文摘網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫(學術(shù)版) 一、數(shù)據(jù)庫介紹 《化學文摘》是化學和生命科學研究領(lǐng)域中不可或缺的參考和研究工具，也是資料量最大，最具權(quán)威的出版物。網(wǎng)絡版化學文摘SciFinder Scholar，更整合了Medline醫(yī)學數(shù)據(jù)庫、歐洲和美國等30幾家專利機構(gòu)的全文專利資料、以及化學文摘1907年至今的所有內(nèi)容。它涵蓋的學科包括應用化學、化學工程、普通化學、物理、生物學、生命科學、醫(yī)學、聚合體學、材料學、地質(zhì)學、食品科學和農(nóng)學等諸多領(lǐng)域。SciFinder Scholar可檢索數(shù)據(jù)庫包括： 數(shù)據(jù)庫 內(nèi)容 ① Reference Databases （文獻數(shù)據(jù)庫） CAPLUSSM 包含來自150 多個國家、9000 多種期刊的文獻，覆蓋1907 年到現(xiàn)在的所有文獻以及部分1907 年以前的文獻，包括有期刊、專利、會議錄、論文、技術(shù)報告、書等，涵蓋化學、生化、化學工程以及相關(guān)學科，還有尚未完全編目收錄的最新文獻。（目前＞2,430 萬條參考書目記錄，每天更新3000 條以上） MEDLINE 包含來自70 多個國家、3900 多種期刊的生物醫(yī)學文獻，覆蓋1951 到現(xiàn)在的所有文獻，以及尚未完全編目收錄的最新文獻。（目前＞1300 萬參考書目記錄，每周更新4 次） ② Structure Database （結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫） REGISTRYSM 涵蓋從1957 年到現(xiàn)在的特定的化學物質(zhì)。REGISTRY 包括了在CASM中引用的物質(zhì)以及特定的注冊。（目前＞7400 萬條物質(zhì)記錄，每天更新約7 萬條，每種化學物質(zhì)有唯一對應的CAS 注冊號） ③ Reaction Database （反應數(shù)據(jù)庫） CASREACT 包括從1907 年到現(xiàn)在的單步或多步反應信息。CASREACT 中的反應包括CAS 編目的反應以及下列來源：ZIC/VINITI 數(shù)據(jù)庫，INPI1986 年以前的數(shù)據(jù)，以及由教授Klaus Kieslich 博士指導編輯的生物轉(zhuǎn)化數(shù)據(jù)庫。（目前＞800 萬條反應記錄和403,000 條文獻記錄 ，每周更新約700-1300 條） ④ Commercial Sources Database （商業(yè)來源數(shù)據(jù)庫） CHEMCATS 化學品的來源信息，包括化學品目錄手冊以及圖書館等內(nèi)的供應商的地址、價格等信息。（目前＞740 萬條商業(yè)化學物質(zhì)記錄，來自655 家供應商的793 種目錄） ⑤ Regulatory Database ( 管制數(shù)據(jù)庫) CHEMLIST 1979 年到現(xiàn)在的管制化學品的信息，包括物質(zhì)的特征、詳細目錄、來源以及許可信息等。（＞22.8 萬種化合物的詳細清單，來自13 個國家和國際性組織，每周更新＞50 條新記錄） 我校也購有CA光盤版，包括1997年至2003年5月的數(shù)據(jù)。 二、SciFinder Scholar (CA)客戶端程序的安裝和運行 SciFinder Scholar （CA）數(shù)據(jù)庫初次使用需要運行安裝客戶端程序，其安裝步驟如下： （一）安裝客戶端程序 (1) 客戶端程序地址：ftp://202.116.69.14/sfs-new.rar，對文件 sfs-new.rar 進行解壓縮，可看到ViewerLite5_04.exe, SFS2004-2.exe和site.prf三個文件 * 對于曾下載并安裝sfs舊版本的用戶：sfs2004-2.exe文件為原來的sfs2004.exe的更新版本，用戶只需在卸載原程序sfs2004.exe程序后安裝程序更新版本sfs2004-2.exe到原安裝目錄文件夾內(nèi)。 * 對于未曾下載sfs舊版本的用戶：可按照接下來的步驟進行安裝； 1. 關(guān)閉其他應用程序。 2. 運行SFS2004-2.exe，按照系統(tǒng)的提示安裝客戶端軟件。建議選用典型安裝。 3. 安裝過程中系統(tǒng)提問“Do you have a disk labeled custom site files?”時，請選擇“否”。其它選擇項默認，完成客戶端軟件SFS2004-2.exe的安裝。 （二）配置客戶端軟件 將解壓縮后得到的文件site.prf復制到客戶端軟件安裝的目錄區(qū)內(nèi)（默認路徑為C:\SFSCHLR）。如果用戶在安裝過程中選擇了其他路徑，請注意路徑和目錄。 （三）安裝ViewerLite ViewerLite是一個觀看三維結(jié)構(gòu)的工具，在SciFinder Scholar檢索出的物質(zhì)結(jié)果中，有很多都是提供3D視圖的，如果安裝了ViewerLite,直接點擊物質(zhì)名上的三維圖像按鈕即可查看。用戶可自行選擇是否安裝：運行解壓縮后得到的文件ViewerLite5_04.exe，按系統(tǒng)提示完成安裝。 （四）訪問SciFinder Scholar數(shù)據(jù)庫 (1) 專線訪問。 (2) 運行SciFinder Scholar客戶端程序：開始>程序>SciFinder Scholar 2004 Edition>SciFinder Scholar (3)開始檢索。 （五）需經(jīng)由代理訪問的IP使用 SciFinder Scholar 方法 凡非正式IP，需經(jīng)由代理服務器訪問校外網(wǎng)絡的用戶，經(jīng)與學校網(wǎng)絡中心的老師溝通，目前只能通過架設(shè)代理層訪問SciFinder Scholar。步驟如下： (1) 下載 SocksCap 軟件并安裝，SocksCap 需要定期更新，請留意更新時間。目前提供其一下載地址：SocksCaP（ftp://202.116.69.14/sc32r237.exe） (2) 啟動 SocksCap 軟件，F(xiàn)ile中選擇“Setting”，在 SOCKS Server 中填寫所使用的代理服務器，如proxy2.zsu.edu.cn；在Port中填寫端口，如1080。（因各校區(qū)代理服務器地址和端口各不相同，請用戶查閱網(wǎng)絡中心發(fā)的校園網(wǎng)用戶管理手冊）。 Protocol選擇 SOCKS 5，其他默認。 (3) 啟動 SocksCap 軟件，點擊“New”，出現(xiàn)“新運行程序”對話框后，點擊“Browse...”，在彈出選擇框內(nèi)選擇在客戶端軟件所安裝的目錄區(qū)（默認路徑為C:\SFSCHLR），然后在其中選擇 sfschlr.exe 程序，然后確定即可。在 SocksCap 內(nèi)運行 sfschlr 即進行連接。 注意：本數(shù)據(jù)庫并發(fā)用戶為5人，北校區(qū)等通過代理訪問的用戶連接速度較慢，如果暫時連接不上，請耐心等候。 三、SciFinder Scholar? 使用的簡單介紹： (一) 進入數(shù)據(jù)庫 雙擊SciFinder Scholar圖標，在License Agreement的彈出窗口中，用戶選擇Accept按鈕， 關(guān)掉Message of day的彈出窗口，就進入了Science Finder Scholar的Explore主檢索界面，見圖2。點擊工具條的第一個圖標New task，也可以得到Explore界面，見圖1。工具條包括常用的一些功能：新任務，后退，向前，打印，保存，全文獲取，參數(shù)設(shè)置，數(shù)據(jù)庫，歷史紀錄，網(wǎng)址，幫助，退出程序。 參數(shù)設(shè)置 新任務 數(shù)據(jù)庫 網(wǎng)址 圖1 公司名稱和研究機構(gòu) 瀏覽目錄 研究主題 文獻情報 著者姓名 化學物質(zhì)或化學反應 圖2 (二) SciFinder Scholar的檢索方法 SciFinder Scholar提供六種基本檢索途徑(見圖二)，下面簡要介紹各種途徑的使用： 1、 化學物質(zhì)或化學反應（Chemical Substance or Reaction） 用戶可以選擇三種途徑檢索： ☉ 化學結(jié)構(gòu)式（Chemical Structure） 您可以在CAS的2200萬種有機和無機物質(zhì)的注冊中，查找結(jié)構(gòu)匹配項。 要按結(jié)構(gòu)檢索，只需使用結(jié)構(gòu)繪圖窗口繪制、導入或者“粘貼”您要檢索的化學結(jié)構(gòu)。如圖3，畫出Ibuprofen 的結(jié)構(gòu)，單擊“Get Substances（獲取化學物質(zhì)）”，然后選擇確切的匹配項或相關(guān)結(jié)構(gòu)，單擊OK。 圖3 您可單擊CAS注冊號上方顯示的任何按鈕，查看相關(guān)物質(zhì)的更多信息。點擊A→B，彈出窗口，選擇該物質(zhì)在反應中的位置，如選擇Product，則將Ibuprofen作為產(chǎn)物的反應檢索出來。如下圖4： 獲取反應 管制化學品 商業(yè)來源信息 物質(zhì)的引文 物質(zhì)的3D 模型 圖4 圖5 也可以點擊反應式中的任何物質(zhì)獲取更多信息，如果點擊Reactions，則彈出選項，這里我們選擇了Substance Detail，提供CAS Registry 記錄，點擊其中的超鏈接，可以查看得到此結(jié)果的參考文獻內(nèi)容。圖5、6。 Get References 可以獲取相關(guān)文獻，Analyze/Refine 可以對結(jié)果進行分析或二次檢索。 圖6 您可以通過繪制化學結(jié)構(gòu)，限定反應中的作用，從700多萬種反應中查找相匹配的信息。 使用結(jié)構(gòu)繪圖板繪制您的反應查詢。添加反應箭頭，制定反應參與項的作用。請單擊“Get Reaction（獲取反應）”。單擊任何反應參與項，獲得該物質(zhì)的更多詳情。要確認該物質(zhì)是否已投入市場、購買地點、銷售價格，請單擊“Commercial Sources（商業(yè)資源）”。您將看到供應商列表。單擊“顯微鏡”圖標，屏幕將提供有關(guān)供應商的詳細信息，包括地址、電話、傳真號碼、電子郵件地址等連連信息。 如果您選擇部分結(jié)構(gòu)檢索功能，SciFinder Scholar為您提供新的結(jié)構(gòu)檢索可能性。 使用機構(gòu)繪圖板繪制相關(guān)子結(jié)構(gòu)。定義立體結(jié)合、環(huán)狀構(gòu)造、鏈鎖結(jié)構(gòu)、替換和取待基團。單擊“Get Substances（獲取物質(zhì)）”并指定子結(jié)構(gòu)。單擊OK。如果結(jié)構(gòu)繪圖包含立體結(jié)構(gòu)。SciFinder Scholar將通過與您的查詢進行比較自動分析您的答案。選擇所需的組要進一步精確查明答案，單擊“Analyze/Refine（分析/精調(diào)）”?！癆nalyze”為您提供若干選項。例如可選擇“Ring Skeletons（環(huán)狀構(gòu)造）”。單擊OK。SciFinder Scholar將根據(jù)同一環(huán)狀構(gòu)造中特定的原子和結(jié)合，對答案集中的物質(zhì)進行分析和分組。 ☉ 物質(zhì)標識符 （Substance Identifier） 您可以從2200萬種有機和無機的物質(zhì)中按化學名稱或CAS注冊號查找相關(guān)物質(zhì)。 通過物質(zhì)標識符進行檢索，輸入一個或多個通用名稱、物質(zhì)別名或CAS注冊號,例如：50-00-0；Acetaminophen，單擊OK。SciFinder Scholar將檢索與您的物質(zhì)標識符相對應的CAS注冊記錄。 ☉ 分子式 （Molecular Formula） 通過分子式進行檢索，SciFinder Scholar 會分析您所輸入的分子式，并重新編排原子，使之成為能被計算機識別的Hill System Order，搜索CAS Registry 數(shù)據(jù)庫，并顯示匹配結(jié)果；如果輸入的原子是模糊的，則彈出窗口提示修改，如元素符號的上標、下表，元素符號之間以空格隔開等（多數(shù)情況下會自動修正）；如果是多組分的物質(zhì)如聚合物，鹽類等，則各個組分之間以英文的句號 . 隔開。如Component1.Component2。 2、 研究主題（Research Topic） 您可以使用描述相關(guān)主題的詞句或詞語，查找CAS數(shù)據(jù)庫中的2300萬參考文獻和MEDLINE中的1340萬種參考文獻。 在“Explore by Research Topic”框中輸入描述您的研究主題的單詞或短語，例如：the effect of antibiotic residues on dairy products。選擇Additional Options按鈕可以從出版年、文獻類型、語種、著者、公司名稱五個方面進行限制。Remove Options按鈕可以回到原來的簡單主題檢索。得到若干候選主題——主題詞之間的邏輯組配，見圖7?？蛇M行多選。選擇合適主題，單擊Get Reference以檢索全部參考文獻。 圖7 圖8截取了部分相關(guān)文獻結(jié)果，單擊右邊有“顯微鏡”的圖標，可以查看完整的書目詳情及相關(guān)參考文獻的摘要。單擊“電腦”圖標，可以查看全文。SciFinder Scholar通過ChemPort連接雜志和專利原文。如果是已經(jīng)訂閱或開放的電子文獻，就可以直接查看全文，當然也有可能出現(xiàn)要求付費才能查看的頁面。Chemport提供了SciFinder收錄的100多年來的許多期刊的全文鏈接，其中核心期刊1870余種（即每一期每篇文章都有鏈接，最新的核心期刊列表請訪問http://www.cas.org/sent.html 查看）SciFinder Scholar 是每天更新的數(shù)據(jù)庫，所以很多最新的全文鏈接也一直被添加進來。SciFinder Scholar中包含了近五百萬條專利記錄，其涵蓋范圍請參看http://www.cas.org/EO/caspat.html 。大部分專利全文都可以在網(wǎng)上免費獲得，Chemport也提供了相應的鏈接。 文摘 全文 圖8 Analyze/Refine按鈕，可以Analyze——對所選文獻按照年、機構(gòu)來源、著者等進行分析得到直方圖（histogram）；或者Refine——從研究主題、機構(gòu)名稱、著者名稱、出版年、文獻類型、語種、數(shù)據(jù)庫、是否可獲取全文八個方面對已有的結(jié)果進行二次檢索。 Get Related可以查看關(guān)聯(lián)信息：所選文獻引用的文獻（Cited Reference），引用所選文獻的文獻（Citing Reference）， 所選文獻中的物質(zhì)（Substance）， 所選文獻中的反應（Reactions），eScience —— 可以將您的檢索擴展到整個網(wǎng)絡。 3、 著者姓名（Author Name） 1907年至今化學和相關(guān)領(lǐng)域內(nèi)任何作者出版的研究文獻，均可通過SciFinder Scholar檢索。 輸入作者姓名時，請記住一定要輸入姓氏（Last Name），名字或中間名是可選項。SciFinder Scholar將提供您所需作者姓名的所有姓氏，包括其它拼寫。對于復姓如OSullivan, Chace-Scott, or Johnson Taylor可直接輸入；如果帶有元音變音的，輸入字母即可，或在后面接一個e，會同時搜索名、姓以及姓、名；對于不確認的名，可以輸入首字母。 4、 文件標識（Document Identifier） 如果您可提供專利號，SciFinder Scholar能夠?qū)⒛B接到其電子版本。 用專利號進行檢索，單擊“Document Identifier（文獻情報）”，在檢索框中鍵入專利號，一次可輸入多個，分行輸入。也可以按單擊“Read from file”按鈕從文件中導入專利號。單擊“顯微鏡”圖標，可以查看專利的詳情。單擊“電腦”圖標，可以通過ChemPort Connection SM鏈接至網(wǎng)站中的電子版專利。下表列出了一些常用的文件標識： Number Examples CA Accession Number 120:15297 1994:15297 Patent number CA 2107100 Patent application number JP 1992-502228 Priority application number IT 1998-BO661 PubMed ID(National Library of Medicine) 2004123 5、 公司名稱和研究機構(gòu)（Company Name/Organization） SciFinder Scholar讓您可輕易地尋找所在研究領(lǐng)域的競爭對手或同事。 要按公司或組織進行檢索，單擊“Company Name/Organization”，輸入您要檢索的組織名稱。要查找該組織是否針對相關(guān)主題進行了研究，請使用SciFinder Scholar地“Refine（精調(diào)）工具，圖9。單擊“Research Topic”輸入您的主題。 SciFinder Scholar的“Analyze（分析）”工具，可進一步確定該組織中是否已有人擁有相關(guān)主題的專利。選擇“Document Type（文檔類型）”，單擊OK。SciFinder Scholar將提供與相關(guān)組織關(guān)聯(lián)的所有文檔類型。要查看專利參考信息的詳情，請選“Patent（專利）”，然后單擊“Get Reference（獲取參考文獻）”。您可使用任何SciFinder Scholar選項，查看不同類型參考文獻。 圖9 6、 瀏覽目錄（Browse Table of Contents） 使用SciFinder Scholar，您可查看1700多種流行科學期刊的目錄，了解已出版的雜志文獻。 從1700多種雜志按字母順序的列表中查找選擇您喜愛的雜志，單擊“View”。也可通過Edit 菜單→Find，查找所需期刊，注意名稱必須完全匹配，一次只能查看一種期刊。默認結(jié)果顯示的是最新一期的目錄，Previouse、Next、Select 可以瀏覽其他期的目錄內(nèi)容。單擊“Select Issue（選擇期刊）”，可選擇卷冊和期刊號。瀏覽期刊的標題，查找相關(guān)文章。要查看書目詳情和文章摘要，請單擊“顯微鏡”圖標。查看文章全文的電子版，單擊“電腦”圖標。 以上對SciFinder Scholar 的使用作一個簡單介紹，更多的內(nèi)容可以參見SciFinder Scholar的幫助文件，菜單中的Help，或F1。 中山大學醫(yī)學圖書館參考咨詢部 聯(lián)系電話:020-87330445，87330804 電子郵件: fmlr@gzsums.edu.cn