生物信息學(xué)本科教學(xué)課件
生物信息學(xué)本科教學(xué)課件,生物信息學(xué),本科教學(xué)課件,生物,信息學(xué),本科,教學(xué),課件
網(wǎng)上生物信息學(xué)資源網(wǎng)上生物信息學(xué)資源主講教師:趙雨杰主講教師:趙雨杰網(wǎng)上生物信息學(xué)資源網(wǎng)上生物信息學(xué)資源網(wǎng)上生物信息學(xué)資源網(wǎng)上生物信息學(xué)資源InternetInternetInternetInternet不僅向其用戶提供了全球范圍的信息交流不僅向其用戶提供了全球范圍的信息交流不僅向其用戶提供了全球范圍的信息交流不僅向其用戶提供了全球范圍的信息交流與快速通訊手段,其本身也具有極其豐富的信息資與快速通訊手段,其本身也具有極其豐富的信息資與快速通訊手段,其本身也具有極其豐富的信息資與快速通訊手段,其本身也具有極其豐富的信息資源,包括新聞、書(shū)刊雜志、數(shù)據(jù)庫(kù)、計(jì)算機(jī)軟件、源,包括新聞、書(shū)刊雜志、數(shù)據(jù)庫(kù)、計(jì)算機(jī)軟件、源,包括新聞、書(shū)刊雜志、數(shù)據(jù)庫(kù)、計(jì)算機(jī)軟件、源,包括新聞、書(shū)刊雜志、數(shù)據(jù)庫(kù)、計(jì)算機(jī)軟件、多媒體資料等,也包括大量的生物信息學(xué)資源。多媒體資料等,也包括大量的生物信息學(xué)資源。多媒體資料等,也包括大量的生物信息學(xué)資源。多媒體資料等,也包括大量的生物信息學(xué)資源。l l文獻(xiàn)、專(zhuān)著數(shù)據(jù)庫(kù)文獻(xiàn)、專(zhuān)著數(shù)據(jù)庫(kù)文獻(xiàn)、專(zhuān)著數(shù)據(jù)庫(kù)文獻(xiàn)、專(zhuān)著數(shù)據(jù)庫(kù)l l核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)l l蛋白序列數(shù)據(jù)庫(kù)蛋白序列數(shù)據(jù)庫(kù)蛋白序列數(shù)據(jù)庫(kù)蛋白序列數(shù)據(jù)庫(kù)l l生物大分子三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)生物大分子三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)生物大分子三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)生物大分子三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)l l化合物數(shù)據(jù)庫(kù)化合物數(shù)據(jù)庫(kù)化合物數(shù)據(jù)庫(kù)化合物數(shù)據(jù)庫(kù)l l功能基因組數(shù)據(jù)庫(kù)功能基因組數(shù)據(jù)庫(kù)功能基因組數(shù)據(jù)庫(kù)功能基因組數(shù)據(jù)庫(kù)l l疾病遺傳變異數(shù)據(jù)庫(kù)疾病遺傳變異數(shù)據(jù)庫(kù)疾病遺傳變異數(shù)據(jù)庫(kù)疾病遺傳變異數(shù)據(jù)庫(kù)l l生物信息學(xué)軟件生物信息學(xué)軟件生物信息學(xué)軟件生物信息學(xué)軟件l l信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)數(shù)據(jù)庫(kù)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)數(shù)據(jù)庫(kù)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)數(shù)據(jù)庫(kù)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)數(shù)據(jù)庫(kù)l l蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)l l實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)及分析軟件數(shù)據(jù)庫(kù)等實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)及分析軟件數(shù)據(jù)庫(kù)等實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)及分析軟件數(shù)據(jù)庫(kù)等實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)及分析軟件數(shù)據(jù)庫(kù)等生物信息學(xué)重要網(wǎng)站生物信息學(xué)重要網(wǎng)站生物信息學(xué)重要網(wǎng)站生物信息學(xué)重要網(wǎng)站美國(guó)生物技術(shù)信息中心(美國(guó)生物技術(shù)信息中心(National Center for National Center for Biotechnology Information,Biotechnology Information,NCBINCBI)(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov)(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov)創(chuàng)建于創(chuàng)建于19881988年年1111月月4 4日,是美國(guó)國(guó)家分子生物學(xué)信日,是美國(guó)國(guó)家分子生物學(xué)信息資源中心,息資源中心,也是全球最有影響的生物學(xué)網(wǎng)也是全球最有影響的生物學(xué)網(wǎng)站之一站之一。NCBINCBI的使命是開(kāi)發(fā)新的信息技術(shù)以協(xié)助更好的使命是開(kāi)發(fā)新的信息技術(shù)以協(xié)助更好地理解那些影響人類(lèi)健康和疾病的分子與遺傳地理解那些影響人類(lèi)健康和疾病的分子與遺傳過(guò)程。過(guò)程。NCBINCBI也從事也從事計(jì)算生物學(xué)計(jì)算生物學(xué)研究,開(kāi)發(fā)用研究,開(kāi)發(fā)用于分析基因組數(shù)據(jù)和傳播生物醫(yī)學(xué)信息的軟件于分析基因組數(shù)據(jù)和傳播生物醫(yī)學(xué)信息的軟件工具。除了工具。除了GenBankGenBank以外,以外,NCBINCBI還支持與推還支持與推廣許多種醫(yī)學(xué)及科技方面的數(shù)據(jù)庫(kù)。廣許多種醫(yī)學(xué)及科技方面的數(shù)據(jù)庫(kù)。歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(EMBLEMBL)與歐洲生與歐洲生與歐洲生與歐洲生物信息學(xué)研究所(物信息學(xué)研究所(物信息學(xué)研究所(物信息學(xué)研究所(EBIEBI)歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(EuropeanMolecularBiologyEuropeanMolecularBiologyLaboratory,EMBLLaboratory,EMBL)()()()(http:/www.embl.org/http:/www.embl.org/)是是是是19741974年由幾乎全部西歐國(guó)家及以色列、阿根廷、澳大利亞年由幾乎全部西歐國(guó)家及以色列、阿根廷、澳大利亞年由幾乎全部西歐國(guó)家及以色列、阿根廷、澳大利亞年由幾乎全部西歐國(guó)家及以色列、阿根廷、澳大利亞等等等等2121個(gè)國(guó)家資助在德國(guó)海德堡建立的國(guó)際研究學(xué)院網(wǎng)個(gè)國(guó)家資助在德國(guó)海德堡建立的國(guó)際研究學(xué)院網(wǎng)個(gè)國(guó)家資助在德國(guó)海德堡建立的國(guó)際研究學(xué)院網(wǎng)個(gè)國(guó)家資助在德國(guó)海德堡建立的國(guó)際研究學(xué)院網(wǎng)絡(luò),致力于分子生物學(xué)研究,分別在德國(guó)、英國(guó)、法絡(luò),致力于分子生物學(xué)研究,分別在德國(guó)、英國(guó)、法絡(luò),致力于分子生物學(xué)研究,分別在德國(guó)、英國(guó)、法絡(luò),致力于分子生物學(xué)研究,分別在德國(guó)、英國(guó)、法國(guó)、意大利設(shè)立國(guó)、意大利設(shè)立國(guó)、意大利設(shè)立國(guó)、意大利設(shè)立5 5個(gè)分支機(jī)構(gòu)。個(gè)分支機(jī)構(gòu)。個(gè)分支機(jī)構(gòu)。個(gè)分支機(jī)構(gòu)。19801980年建立了世界上第年建立了世界上第年建立了世界上第年建立了世界上第一個(gè)核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)即一個(gè)核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)即一個(gè)核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)即一個(gè)核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)即EMBLEMBL核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)。核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)。核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)。核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)。歐洲生物信息學(xué)研究所(歐洲生物信息學(xué)研究所(歐洲生物信息學(xué)研究所(歐洲生物信息學(xué)研究所(EuropeanBioinformaticsEuropeanBioinformaticsInstitute,EBIInstitute,EBI)()()()(http:/www.ebi.ac.ukhttp:/www.ebi.ac.uk)是是是是EMBLEMBL的一部分,是由歐盟資助于的一部分,是由歐盟資助于的一部分,是由歐盟資助于的一部分,是由歐盟資助于19921992年在英國(guó)建立的一年在英國(guó)建立的一年在英國(guó)建立的一年在英國(guó)建立的一個(gè)非盈利性的學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu),也是生物信息學(xué)研究與服個(gè)非盈利性的學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu),也是生物信息學(xué)研究與服個(gè)非盈利性的學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu),也是生物信息學(xué)研究與服個(gè)非盈利性的學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu),也是生物信息學(xué)研究與服務(wù)的歐洲中心。務(wù)的歐洲中心。務(wù)的歐洲中心。務(wù)的歐洲中心。EBIEBI建立在建立在建立在建立在EMBLEMBL的核苷酸序列數(shù)的核苷酸序列數(shù)的核苷酸序列數(shù)的核苷酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)的基礎(chǔ)之上,同時(shí)該研究所也開(kāi)發(fā)有多種生物據(jù)庫(kù)的基礎(chǔ)之上,同時(shí)該研究所也開(kāi)發(fā)有多種生物據(jù)庫(kù)的基礎(chǔ)之上,同時(shí)該研究所也開(kāi)發(fā)有多種生物據(jù)庫(kù)的基礎(chǔ)之上,同時(shí)該研究所也開(kāi)發(fā)有多種生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),向研究人員提供來(lái)自于學(xué)術(shù)界的分子生學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),向研究人員提供來(lái)自于學(xué)術(shù)界的分子生學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),向研究人員提供來(lái)自于學(xué)術(shù)界的分子生學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),向研究人員提供來(lái)自于學(xué)術(shù)界的分子生物學(xué)、遺傳學(xué)、醫(yī)學(xué)及農(nóng)業(yè)、生物技術(shù)、化學(xué)、藥物學(xué)、遺傳學(xué)、醫(yī)學(xué)及農(nóng)業(yè)、生物技術(shù)、化學(xué)、藥物學(xué)、遺傳學(xué)、醫(yī)學(xué)及農(nóng)業(yè)、生物技術(shù)、化學(xué)、藥物學(xué)、遺傳學(xué)、醫(yī)學(xué)及農(nóng)業(yè)、生物技術(shù)、化學(xué)、藥學(xué)工業(yè)等方面的資源信息。學(xué)工業(yè)等方面的資源信息。學(xué)工業(yè)等方面的資源信息。學(xué)工業(yè)等方面的資源信息。網(wǎng)上生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)上生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)主講教師:趙雨杰主講教師:趙雨杰數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)核核核核酸酸酸酸序序序序列列列列數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù):EMBLEMBL(EMBLEMBL核核核核酸酸酸酸序序序序列列列列數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù))、EnsemblEnsembl(真真真真 核核核核 細(xì)細(xì)細(xì)細(xì) 胞胞胞胞 基基基基 因因因因 組組組組 自自自自 動(dòng)動(dòng)動(dòng)動(dòng) 注注注注 釋釋釋釋?zhuān)?、EMESTEMEST(ESTEST序序序序列列列列數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù))、MitBaseMitBaseServerServer(線線線線粒粒粒粒體體體體DNADNA數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)服服服服務(wù)務(wù)務(wù)務(wù)器器器器)、EDGPEDGP(歐歐歐歐洲洲洲洲果果果果蠅蠅蠅蠅基基基基因因因因組組組組項(xiàng)項(xiàng)項(xiàng)項(xiàng)目服務(wù)器)、目服務(wù)器)、目服務(wù)器)、目服務(wù)器)、ParasitesParasites(寄生蟲(chóng)基因組數(shù)據(jù)庫(kù))等。寄生蟲(chóng)基因組數(shù)據(jù)庫(kù))等。寄生蟲(chóng)基因組數(shù)據(jù)庫(kù))等。寄生蟲(chóng)基因組數(shù)據(jù)庫(kù))等。蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù):蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù):蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù):蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù):SWISS-PROTSWISS-PROT(蛋白質(zhì)序列注(蛋白質(zhì)序列注(蛋白質(zhì)序列注(蛋白質(zhì)序列注釋性數(shù)據(jù)庫(kù))、釋性數(shù)據(jù)庫(kù))、釋性數(shù)據(jù)庫(kù))、釋性數(shù)據(jù)庫(kù))、TrEMBLTrEMBL(計(jì)算機(jī)注釋的蛋白質(zhì)序(計(jì)算機(jī)注釋的蛋白質(zhì)序(計(jì)算機(jī)注釋的蛋白質(zhì)序(計(jì)算機(jī)注釋的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù))及列數(shù)據(jù)庫(kù))及列數(shù)據(jù)庫(kù))及列數(shù)據(jù)庫(kù))及InterProInterPro等。等。等。等。全部基因組數(shù)據(jù)庫(kù):全部基因組數(shù)據(jù)庫(kù):全部基因組數(shù)據(jù)庫(kù):全部基因組數(shù)據(jù)庫(kù):Completed Genomics at the EBICompleted Genomics at the EBI。從人類(lèi)基因組項(xiàng)目一開(kāi)始,國(guó)際人類(lèi)基因組序列聯(lián)盟。從人類(lèi)基因組項(xiàng)目一開(kāi)始,國(guó)際人類(lèi)基因組序列聯(lián)盟。從人類(lèi)基因組項(xiàng)目一開(kāi)始,國(guó)際人類(lèi)基因組序列聯(lián)盟。從人類(lèi)基因組項(xiàng)目一開(kāi)始,國(guó)際人類(lèi)基因組序列聯(lián)盟即向國(guó)際核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)(即向國(guó)際核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)(即向國(guó)際核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)(即向國(guó)際核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)(DDBJ/EMBL/GenBankDDBJ/EMBL/GenBank)提供人類(lèi)序列草圖數(shù)據(jù)。通過(guò)提供人類(lèi)序列草圖數(shù)據(jù)。通過(guò)提供人類(lèi)序列草圖數(shù)據(jù)。通過(guò)提供人類(lèi)序列草圖數(shù)據(jù)。通過(guò)EBIEBI服務(wù)器及時(shí)地向研究服務(wù)器及時(shí)地向研究服務(wù)器及時(shí)地向研究服務(wù)器及時(shí)地向研究者提供大量的人類(lèi)基因組序列信息,這些數(shù)據(jù)最終合并者提供大量的人類(lèi)基因組序列信息,這些數(shù)據(jù)最終合并者提供大量的人類(lèi)基因組序列信息,這些數(shù)據(jù)最終合并者提供大量的人類(lèi)基因組序列信息,這些數(shù)據(jù)最終合并到到到到EMBLEMBL數(shù)據(jù)庫(kù)中。數(shù)據(jù)庫(kù)中。數(shù)據(jù)庫(kù)中。數(shù)據(jù)庫(kù)中。序列結(jié)構(gòu)分類(lèi)數(shù)據(jù)庫(kù):序列結(jié)構(gòu)分類(lèi)數(shù)據(jù)庫(kù):DSSPDSSP(二級(jí)結(jié)構(gòu)分配數(shù)據(jù)(二級(jí)結(jié)構(gòu)分配數(shù)據(jù)庫(kù))、庫(kù))、HSSPHSSP(同源二級(jí)結(jié)構(gòu)分配數(shù)據(jù)庫(kù)(同源二級(jí)結(jié)構(gòu)分配數(shù)據(jù)庫(kù))、DALIDALI(蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域詞典)等。(蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域詞典)等。大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù):大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù):EBI-MSDEBI-MSD(EBIEBI大分子結(jié)構(gòu)數(shù)大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù))等。據(jù)庫(kù))等。人類(lèi)蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù):人類(lèi)蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù):人類(lèi)蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù):人類(lèi)蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù):HPIHPI(Human Proteomics Human Proteomics Initiative Initiative 人類(lèi)蛋白質(zhì)組學(xué)起步人類(lèi)蛋白質(zhì)組學(xué)起步人類(lèi)蛋白質(zhì)組學(xué)起步人類(lèi)蛋白質(zhì)組學(xué)起步)。19991999年年年年7 7月,月,月,月,EMBLEMBL開(kāi)始了一個(gè)主要項(xiàng)目即根據(jù)高質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)的開(kāi)始了一個(gè)主要項(xiàng)目即根據(jù)高質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)的開(kāi)始了一個(gè)主要項(xiàng)目即根據(jù)高質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)的開(kāi)始了一個(gè)主要項(xiàng)目即根據(jù)高質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)的SWISS-PROTSWISS-PROT蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)對(duì)已知的人類(lèi)蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)對(duì)已知的人類(lèi)蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)對(duì)已知的人類(lèi)蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)對(duì)已知的人類(lèi)蛋白質(zhì)序列進(jìn)行注解,提供包括已知蛋白質(zhì)的功能描述、序列進(jìn)行注解,提供包括已知蛋白質(zhì)的功能描述、序列進(jìn)行注解,提供包括已知蛋白質(zhì)的功能描述、序列進(jìn)行注解,提供包括已知蛋白質(zhì)的功能描述、域結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞區(qū)域、翻譯后修飾、變異及與其它域結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞區(qū)域、翻譯后修飾、變異及與其它域結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞區(qū)域、翻譯后修飾、變異及與其它域結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞區(qū)域、翻譯后修飾、變異及與其它蛋白質(zhì)的相似性等大量信息。蛋白質(zhì)的相似性等大量信息。蛋白質(zhì)的相似性等大量信息。蛋白質(zhì)的相似性等大量信息。序列圖譜數(shù)據(jù)庫(kù):序列圖譜數(shù)據(jù)庫(kù):序列圖譜數(shù)據(jù)庫(kù):序列圖譜數(shù)據(jù)庫(kù):RHdb ServerRHdb Server(放射雜交數(shù)據(jù)庫(kù)(放射雜交數(shù)據(jù)庫(kù)(放射雜交數(shù)據(jù)庫(kù)(放射雜交數(shù)據(jù)庫(kù)服務(wù)器)、服務(wù)器)、服務(wù)器)、服務(wù)器)、GenomeMaps98GenomeMaps98(人類(lèi)基因圖(人類(lèi)基因圖(人類(lèi)基因圖(人類(lèi)基因圖9898)。)。)。)。此外,該網(wǎng)站還提供此外,該網(wǎng)站還提供此外,該網(wǎng)站還提供此外,該網(wǎng)站還提供SRSSRS、FASTAFASTA、WU-BLASTWU-BLAST、CLUSTALCLUSTAL等工具。等工具。等工具。等工具。蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)分析專(zhuān)家系統(tǒng)分析專(zhuān)家系統(tǒng)分析專(zhuān)家系統(tǒng)分析專(zhuān)家系統(tǒng)(ExPASyExPASy)蛋白質(zhì)分析專(zhuān)家系統(tǒng)(蛋白質(zhì)分析專(zhuān)家系統(tǒng)(蛋白質(zhì)分析專(zhuān)家系統(tǒng)(蛋白質(zhì)分析專(zhuān)家系統(tǒng)(Expert Protein Analysis System,Expert Protein Analysis System,Expert Protein Analysis System,Expert Protein Analysis System,ExPASyExPASyExPASyExPASy)(http:/www.expasy.ch)(http:/www.expasy.ch)(http:/www.expasy.ch)(http:/www.expasy.ch)是由瑞士生物信息學(xué)院是由瑞士生物信息學(xué)院是由瑞士生物信息學(xué)院是由瑞士生物信息學(xué)院(Swiss Institute of Bioinformatics,SIB)Swiss Institute of Bioinformatics,SIB)Swiss Institute of Bioinformatics,SIB)Swiss Institute of Bioinformatics,SIB)(http:/www.isb-http:/www.isb-http:/www.isb-http:/www.isb-sib.ch/sib.ch/sib.ch/sib.ch/)于于于于1994199419941994年初創(chuàng)建的世界上第一個(gè)分子生物學(xué)網(wǎng)年初創(chuàng)建的世界上第一個(gè)分子生物學(xué)網(wǎng)年初創(chuàng)建的世界上第一個(gè)分子生物學(xué)網(wǎng)年初創(chuàng)建的世界上第一個(gè)分子生物學(xué)網(wǎng)站,專(zhuān)門(mén)分析蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)、功能和蛋白質(zhì)站,專(zhuān)門(mén)分析蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)、功能和蛋白質(zhì)站,專(zhuān)門(mén)分析蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)、功能和蛋白質(zhì)站,專(zhuān)門(mén)分析蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)、功能和蛋白質(zhì)2 2 2 2D-D-D-D-PAGEPAGEPAGEPAGE圖譜。圖譜。圖譜。圖譜。ExPASyExPASy分子生物學(xué)服務(wù)器分子生物學(xué)服務(wù)器分子生物學(xué)服務(wù)器分子生物學(xué)服務(wù)器http:/www.expasy.orghttp:/www.expasy.org/結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)研究聯(lián)合結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)研究聯(lián)合結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)研究聯(lián)合結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)研究聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室實(shí)驗(yàn)室實(shí)驗(yàn)室實(shí)驗(yàn)室(RCSBRCSB)結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)研究聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室(結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)研究聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室(結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)研究聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室(結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)研究聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室(TheResearchTheResearchCollaboratoryforStructuralBioinformatics,CollaboratoryforStructuralBioinformatics,RCSBRCSB)()()()(http:/www.rcsb.org/index.htmlhttp:/www.rcsb.org/index.html)是一個(gè)是一個(gè)是一個(gè)是一個(gè)非盈利性研究機(jī)構(gòu),主要致力于通過(guò)對(duì)生物大分子非盈利性研究機(jī)構(gòu),主要致力于通過(guò)對(duì)生物大分子非盈利性研究機(jī)構(gòu),主要致力于通過(guò)對(duì)生物大分子非盈利性研究機(jī)構(gòu),主要致力于通過(guò)對(duì)生物大分子三維結(jié)構(gòu)的研究進(jìn)一步探索生物系統(tǒng)的功能三維結(jié)構(gòu)的研究進(jìn)一步探索生物系統(tǒng)的功能三維結(jié)構(gòu)的研究進(jìn)一步探索生物系統(tǒng)的功能三維結(jié)構(gòu)的研究進(jìn)一步探索生物系統(tǒng)的功能。RCSBRCSB可提供服務(wù)的數(shù)據(jù)庫(kù)可提供服務(wù)的數(shù)據(jù)庫(kù)可提供服務(wù)的數(shù)據(jù)庫(kù)可提供服務(wù)的數(shù)據(jù)庫(kù)PDBPDB生生生生物物物物大大大大分分分分子子子子結(jié)結(jié)結(jié)結(jié)構(gòu)構(gòu)構(gòu)構(gòu)數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)(ProteinProteinDataDataBankBank,PDBPDB)(http:/www.rcsb.org/index.htmlhttp:/www.rcsb.org/index.html)PDBPDB數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)是是是是包包包包括括括括蛋蛋蛋蛋白白白白質(zhì)質(zhì)質(zhì)質(zhì)、核核核核酸酸酸酸、蛋蛋蛋蛋白白白白質(zhì)質(zhì)質(zhì)質(zhì)-核核核核酸酸酸酸復(fù)復(fù)復(fù)復(fù)合合合合物物物物及及及及病病病病毒毒毒毒等等等等生生生生物物物物大大大大分分分分子子子子的的的的三三三三維維維維結(jié)結(jié)結(jié)結(jié)構(gòu)構(gòu)構(gòu)構(gòu)數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)。其其其其FTPFTP匿匿匿匿名名名名服服服服務(wù)務(wù)務(wù)務(wù)器器器器站站站站點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)為為為為:ftp:/ftp.rcsb.org/ftp:/ftp.rcsb.org/,通通通通過(guò)過(guò)過(guò)過(guò)此此此此站站站站點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)可可可可網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)上上上上下載下載下載下載PDBPDB的生物大分子三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)。的生物大分子三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)。的生物大分子三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)。的生物大分子三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)。NDBNDB核核核核 酸酸酸酸 數(shù)數(shù)數(shù)數(shù) 據(jù)據(jù)據(jù)據(jù) 庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù) (NucleicNucleicAcidAcidDatabaseDatabase)(http:/ndbserver.rutgers.edu/ND(http:/ndbserver.rutgers.edu/NDB/ndb.html)B/ndb.html)NDBNDB數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)主主主主要要要要收收收收集集集集與與與與發(fā)發(fā)發(fā)發(fā)布布布布核核核核酸的結(jié)構(gòu)信息。酸的結(jié)構(gòu)信息。酸的結(jié)構(gòu)信息。酸的結(jié)構(gòu)信息。此外,此外,此外,此外,RCSBRCSB還在其網(wǎng)站上提供了其開(kāi)發(fā)的結(jié)還在其網(wǎng)站上提供了其開(kāi)發(fā)的結(jié)還在其網(wǎng)站上提供了其開(kāi)發(fā)的結(jié)還在其網(wǎng)站上提供了其開(kāi)發(fā)的結(jié)構(gòu)分析工具、標(biāo)準(zhǔn)和教學(xué)服務(wù)信息等。構(gòu)分析工具、標(biāo)準(zhǔn)和教學(xué)服務(wù)信息等。構(gòu)分析工具、標(biāo)準(zhǔn)和教學(xué)服務(wù)信息等。構(gòu)分析工具、標(biāo)準(zhǔn)和教學(xué)服務(wù)信息等。日本國(guó)立遺傳學(xué)研究所日本國(guó)立遺傳學(xué)研究所日本國(guó)立遺傳學(xué)研究所日本國(guó)立遺傳學(xué)研究所 日本國(guó)立遺傳學(xué)研究所(日本國(guó)立遺傳學(xué)研究所(日本國(guó)立遺傳學(xué)研究所(日本國(guó)立遺傳學(xué)研究所(NationalInstituteofGeneticsNationalInstituteofGenetics,NIGNIG)()()()(http:/www.nig.ac.jp/http:/www.nig.ac.jp/)創(chuàng)建于創(chuàng)建于創(chuàng)建于創(chuàng)建于19491949年,是日年,是日年,是日年,是日本遺傳學(xué)各方面研究的中心研究機(jī)構(gòu)及生命科學(xué)所有領(lǐng)本遺傳學(xué)各方面研究的中心研究機(jī)構(gòu)及生命科學(xué)所有領(lǐng)本遺傳學(xué)各方面研究的中心研究機(jī)構(gòu)及生命科學(xué)所有領(lǐng)本遺傳學(xué)各方面研究的中心研究機(jī)構(gòu)及生命科學(xué)所有領(lǐng)域的研究基地。該研究所的著名數(shù)據(jù)庫(kù)是日本域的研究基地。該研究所的著名數(shù)據(jù)庫(kù)是日本域的研究基地。該研究所的著名數(shù)據(jù)庫(kù)是日本域的研究基地。該研究所的著名數(shù)據(jù)庫(kù)是日本DNADNA數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)(據(jù)庫(kù)(據(jù)庫(kù)(據(jù)庫(kù)(DNADataBankofJapanDNADataBankofJapan)即即即即DDBJDDBJ(http:/www.ddbj.nig.ac.jp/http:/www.ddbj.nig.ac.jp/)。)。)。)。DDBJDDBJ是是是是日日日日本本本本唯唯唯唯一一一一的的的的DNADNA數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)。通通通通過(guò)過(guò)過(guò)過(guò)該該該該數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)的的的的檢檢檢檢索索索索界界界界面面面面(http:/www.ddbj.nig.ac.jp/http:/www.ddbj.nig.ac.jp/)可可可可選選選選擇擇擇擇性性性性檢檢檢檢索索索索DDBJDDBJ、PDBPDB、SWISSPROTSWISSPROT、PIRPIR、ENZYMEENZYME、PROSITEPROSITE等等等等2020多多多多個(gè)個(gè)個(gè)個(gè)數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù),也也也也可可可可以以以以同時(shí)檢索多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)。同時(shí)檢索多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)。同時(shí)檢索多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)。同時(shí)檢索多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)。美國(guó)美國(guó)美國(guó)美國(guó)WhiteheadWhitehead生物醫(yī)學(xué)生物醫(yī)學(xué)生物醫(yī)學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究所研究所研究所研究所麻麻麻麻省理工學(xué)院基因組研究中心省理工學(xué)院基因組研究中心省理工學(xué)院基因組研究中心省理工學(xué)院基因組研究中心 美國(guó)美國(guó)美國(guó)美國(guó)WhiteheadWhitehead生物醫(yī)學(xué)研究所麻省理工學(xué)院基生物醫(yī)學(xué)研究所麻省理工學(xué)院基生物醫(yī)學(xué)研究所麻省理工學(xué)院基生物醫(yī)學(xué)研究所麻省理工學(xué)院基因組研究中心(因組研究中心(因組研究中心(因組研究中心(WhiteheadInstituteforBiomedicalWhiteheadInstituteforBiomedicalResearch/MITCenterforGenomeResearchResearch/MITCenterforGenomeResearch)(http:/genome-asia.ucsc.edu/index.html)(http:/genome-asia.ucsc.edu/index.html)的的的的WebWeb服務(wù)服務(wù)服務(wù)服務(wù)器提供基因組序列、基因組圖譜、基因組中心軟件、器提供基因組序列、基因組圖譜、基因組中心軟件、器提供基因組序列、基因組圖譜、基因組中心軟件、器提供基因組序列、基因組圖譜、基因組中心軟件、基因組中心信息等資源?;蚪M中心信息等資源?;蚪M中心信息等資源。基因組中心信息等資源。生物分子序列核心數(shù)據(jù)庫(kù)生物分子序列核心數(shù)據(jù)庫(kù)GenBank核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù) 主講教師:趙雨杰主講教師:趙雨杰當(dāng)前,在當(dāng)前,在當(dāng)前,在當(dāng)前,在InternetInternet網(wǎng)上可以查詢到大量的生物信息學(xué)網(wǎng)上可以查詢到大量的生物信息學(xué)網(wǎng)上可以查詢到大量的生物信息學(xué)網(wǎng)上可以查詢到大量的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),但其中最重要數(shù)據(jù)庫(kù),但其中最重要數(shù)據(jù)庫(kù),但其中最重要數(shù)據(jù)庫(kù),但其中最重要最核心的三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)為:最核心的三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)為:最核心的三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)為:最核心的三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)為:GenGenBankBank核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)、核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)、核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)、核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)、UniProtKBUniProtKBUniProtKB蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)和庫(kù)和庫(kù)和庫(kù)和PDBPDB生物大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)生物大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)生物大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)生物大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù),該三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)是分,該三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)是分,該三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)是分,該三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)是分子生物學(xué)研究人員不可忽視的信息來(lái)源。子生物學(xué)研究人員不可忽視的信息來(lái)源。子生物學(xué)研究人員不可忽視的信息來(lái)源。子生物學(xué)研究人員不可忽視的信息來(lái)源。通過(guò)該三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù),可以較完整地獲得生物大分子的通過(guò)該三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù),可以較完整地獲得生物大分子的通過(guò)該三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù),可以較完整地獲得生物大分子的通過(guò)該三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù),可以較完整地獲得生物大分子的序列、結(jié)構(gòu)等信息。同時(shí),研究者也可以將測(cè)定的序序列、結(jié)構(gòu)等信息。同時(shí),研究者也可以將測(cè)定的序序列、結(jié)構(gòu)等信息。同時(shí),研究者也可以將測(cè)定的序序列、結(jié)構(gòu)等信息。同時(shí),研究者也可以將測(cè)定的序列或結(jié)構(gòu)研究結(jié)果通過(guò)這些數(shù)據(jù)庫(kù)予以認(rèn)定、發(fā)表、列或結(jié)構(gòu)研究結(jié)果通過(guò)這些數(shù)據(jù)庫(kù)予以認(rèn)定、發(fā)表、列或結(jié)構(gòu)研究結(jié)果通過(guò)這些數(shù)據(jù)庫(kù)予以認(rèn)定、發(fā)表、列或結(jié)構(gòu)研究結(jié)果通過(guò)這些數(shù)據(jù)庫(kù)予以認(rèn)定、發(fā)表、交流。三大核心數(shù)據(jù)庫(kù)各自有獨(dú)立的網(wǎng)站提供檢索服交流。三大核心數(shù)據(jù)庫(kù)各自有獨(dú)立的網(wǎng)站提供檢索服交流。三大核心數(shù)據(jù)庫(kù)各自有獨(dú)立的網(wǎng)站提供檢索服交流。三大核心數(shù)據(jù)庫(kù)各自有獨(dú)立的網(wǎng)站提供檢索服務(wù),同時(shí)又可以相互鏈接,交叉檢索。務(wù),同時(shí)又可以相互鏈接,交叉檢索。務(wù),同時(shí)又可以相互鏈接,交叉檢索。務(wù),同時(shí)又可以相互鏈接,交叉檢索。1.1.GenBankGenBank核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù) GenBankGenBank(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.htmlhtml)創(chuàng)立于創(chuàng)立于創(chuàng)立于創(chuàng)立于19821982年,是美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院遺傳學(xué)序年,是美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院遺傳學(xué)序年,是美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院遺傳學(xué)序年,是美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院遺傳學(xué)序列數(shù)據(jù)庫(kù)。作為目前世界上最重要的核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù),列數(shù)據(jù)庫(kù)。作為目前世界上最重要的核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù),列數(shù)據(jù)庫(kù)。作為目前世界上最重要的核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù),列數(shù)據(jù)庫(kù)。作為目前世界上最重要的核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù),是生物分子的三大核心數(shù)據(jù)庫(kù)之一,也是國(guó)際核酸序列是生物分子的三大核心數(shù)據(jù)庫(kù)之一,也是國(guó)際核酸序列是生物分子的三大核心數(shù)據(jù)庫(kù)之一,也是國(guó)際核酸序列是生物分子的三大核心數(shù)據(jù)庫(kù)之一,也是國(guó)際核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)協(xié)作網(wǎng)(數(shù)據(jù)庫(kù)協(xié)作網(wǎng)(數(shù)據(jù)庫(kù)協(xié)作網(wǎng)(數(shù)據(jù)庫(kù)協(xié)作網(wǎng)(InternationalNucleotideSequenceInternationalNucleotideSequenceDatabaseCollaborationDatabaseCollaboration)(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/collab/http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/collab/)的主要組成部分。的主要組成部分。的主要組成部分。的主要組成部分。19921992年年年年1111月起,月起,月起,月起,NCBINCBI開(kāi)始承擔(dān)開(kāi)始承擔(dān)開(kāi)始承擔(dān)開(kāi)始承擔(dān)GenBankGenBank的的的的DNADNA序序序序列數(shù)據(jù)庫(kù)的維護(hù)與服務(wù)。列數(shù)據(jù)庫(kù)的維護(hù)與服務(wù)。列數(shù)據(jù)庫(kù)的維護(hù)與服務(wù)。列數(shù)據(jù)庫(kù)的維護(hù)與服務(wù)。NCBINCBI受過(guò)分子生物學(xué)高級(jí)受過(guò)分子生物學(xué)高級(jí)受過(guò)分子生物學(xué)高級(jí)受過(guò)分子生物學(xué)高級(jí)培訓(xùn)的工作人員將世界各地實(shí)驗(yàn)室提交的核酸序列培訓(xùn)的工作人員將世界各地實(shí)驗(yàn)室提交的核酸序列培訓(xùn)的工作人員將世界各地實(shí)驗(yàn)室提交的核酸序列培訓(xùn)的工作人員將世界各地實(shí)驗(yàn)室提交的核酸序列以及與國(guó)際上其它核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)如:以及與國(guó)際上其它核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)如:以及與國(guó)際上其它核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)如:以及與國(guó)際上其它核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)如:歐洲分子生歐洲分子生歐洲分子生歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(EuropeanMolecularBiologyEuropeanMolecularBiologyLaboratory,EMBLLaboratory,EMBL)、)、)、)、日本日本日本日本DNADNA數(shù)據(jù)庫(kù)(數(shù)據(jù)庫(kù)(數(shù)據(jù)庫(kù)(數(shù)據(jù)庫(kù)(DNADNADataBankofJapanDataBankofJapan,DDBJDDBJ)等交換獲得的核酸序等交換獲得的核酸序等交換獲得的核酸序等交換獲得的核酸序列數(shù)據(jù)加入到數(shù)據(jù)庫(kù)中。列數(shù)據(jù)加入到數(shù)據(jù)庫(kù)中。列數(shù)據(jù)加入到數(shù)據(jù)庫(kù)中。列數(shù)據(jù)加入到數(shù)據(jù)庫(kù)中。三大核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)三大核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)三大核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)三大核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)。2 2.GenBankGenBank的查詢檢索的查詢檢索的查詢檢索的查詢檢索檢索查詢檢索查詢檢索查詢檢索查詢GenBankGenBank的最簡(jiǎn)捷途徑是在的最簡(jiǎn)捷途徑是在的最簡(jiǎn)捷途徑是在的最簡(jiǎn)捷途徑是在NCBINCBI首頁(yè)首頁(yè)首頁(yè)首頁(yè)上的上的上的上的“Search”Search”選項(xiàng)中選擇選項(xiàng)中選擇選項(xiàng)中選擇選項(xiàng)中選擇“Nucleotide”Nucleotide”選項(xiàng),選項(xiàng),選項(xiàng),選項(xiàng),在檢索窗口內(nèi)輸入欲查詢序列的檢索詞,再點(diǎn)擊在檢索窗口內(nèi)輸入欲查詢序列的檢索詞,再點(diǎn)擊在檢索窗口內(nèi)輸入欲查詢序列的檢索詞,再點(diǎn)擊在檢索窗口內(nèi)輸入欲查詢序列的檢索詞,再點(diǎn)擊“Search”Search”按鈕即可進(jìn)入按鈕即可進(jìn)入按鈕即可進(jìn)入按鈕即可進(jìn)入檢索。也可以點(diǎn)擊主頁(yè)檢索。也可以點(diǎn)擊主頁(yè)檢索。也可以點(diǎn)擊主頁(yè)檢索。也可以點(diǎn)擊主頁(yè)下面的下面的下面的下面的GenBankGenBank提示按鈕進(jìn)入提示按鈕進(jìn)入提示按鈕進(jìn)入提示按鈕進(jìn)入GenBankGenBank數(shù)據(jù)庫(kù)首數(shù)據(jù)庫(kù)首數(shù)據(jù)庫(kù)首數(shù)據(jù)庫(kù)首頁(yè)。頁(yè)。頁(yè)。頁(yè)。檢索時(shí),在檢索時(shí),在檢索時(shí),在檢索時(shí),在EntrezEntrez首頁(yè)上的菜單中選擇首頁(yè)上的菜單中選擇首頁(yè)上的菜單中選擇首頁(yè)上的菜單中選擇“Nucleotide”Nucleotide”即可進(jìn)入即可進(jìn)入即可進(jìn)入即可進(jìn)入“EntrezNucleotideEntrezNucleotideSequenceSearchSequenceSearch(EntrezEntrez核苷酸序列檢索)核苷酸序列檢索)核苷酸序列檢索)核苷酸序列檢索)”界面。界面。界面。界面?;緳z索方法是在檢索窗口內(nèi)直接輸入檢索詞,其基本檢索方法是在檢索窗口內(nèi)直接輸入檢索詞,其基本檢索方法是在檢索窗口內(nèi)直接輸入檢索詞,其基本檢索方法是在檢索窗口內(nèi)直接輸入檢索詞,其檢索詞輸入方法及組配方式相似于檢索詞輸入方法及組配方式相似于檢索詞輸入方法及組配方式相似于檢索詞輸入方法及組配方式相似于Entrez-PubMedEntrez-PubMed的的的的MEDLINEMEDLINE檢索。檢索。檢索。檢索。對(duì)核苷酸序列庫(kù)的相應(yīng)字段進(jìn)行限定性檢索,需通對(duì)核苷酸序列庫(kù)的相應(yīng)字段進(jìn)行限定性檢索,需通對(duì)核苷酸序列庫(kù)的相應(yīng)字段進(jìn)行限定性檢索,需通對(duì)核苷酸序列庫(kù)的相應(yīng)字段進(jìn)行限定性檢索,需通過(guò)點(diǎn)擊檢索窗口下方的過(guò)點(diǎn)擊檢索窗口下方的過(guò)點(diǎn)擊檢索窗口下方的過(guò)點(diǎn)擊檢索窗口下方的“Advanced”Advanced”鏈接按鈕,進(jìn)鏈接按鈕,進(jìn)鏈接按鈕,進(jìn)鏈接按鈕,進(jìn)入限定性檢索界面。首先在檢索框中輸入檢索詞,入限定性檢索界面。首先在檢索框中輸入檢索詞,入限定性檢索界面。首先在檢索框中輸入檢索詞,入限定性檢索界面。首先在檢索框中輸入檢索詞,然后在然后在然后在然后在“SearchField”SearchField”下拉菜單選項(xiàng)中選擇相應(yīng)的下拉菜單選項(xiàng)中選擇相應(yīng)的下拉菜單選項(xiàng)中選擇相應(yīng)的下拉菜單選項(xiàng)中選擇相應(yīng)的檢索字段。檢索字段。檢索字段。檢索字段。NCBINCBI核苷酸序列檢索結(jié)果顯示界面核苷酸序列檢索結(jié)果顯示界面基因檢索基因檢索GenBankGenBank數(shù)據(jù)呈報(bào)數(shù)據(jù)呈報(bào)數(shù)據(jù)呈報(bào)數(shù)據(jù)呈報(bào) 許許許許多多多多期期期期刊刊刊刊要要要要求求求求文文文文獻(xiàn)獻(xiàn)獻(xiàn)獻(xiàn)作作作作者者者者在在在在投投投投稿稿稿稿之之之之前前前前向向向向GenBankGenBank數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)呈呈呈呈報(bào)報(bào)報(bào)報(bào)序序序序列列列列信信信信息息息息,使使使使得得得得在在在在發(fā)發(fā)發(fā)發(fā)表表表表的的的的論論論論文文文文中中中中可可可可具具具具有有有有數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)登登登登記記記記號(hào)號(hào)號(hào)號(hào)。向向向向GenBankGenBank直直直直接接接接呈呈呈呈報(bào)報(bào)報(bào)報(bào)序序序序列列列列數(shù)數(shù)數(shù)數(shù) 據(jù)據(jù)據(jù)據(jù) 的的的的 方方方方 便便便便 快快快快 捷捷捷捷 方方方方 式式式式 是是是是 通通通通 過(guò)過(guò)過(guò)過(guò)“BankItBankIt”(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Bahttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt/nkIt/)軟軟軟軟件件件件?!癇ankItBankIt”是是是是NCBINCBI通通通通過(guò)過(guò)過(guò)過(guò)WWWWWW向向向向GenBankGenBank呈報(bào)序列數(shù)據(jù)的工具軟件。呈報(bào)序列數(shù)據(jù)的工具軟件。呈報(bào)序列數(shù)據(jù)的工具軟件。呈報(bào)序列數(shù)據(jù)的工具軟件。當(dāng)當(dāng)當(dāng)當(dāng)要要要要呈呈呈呈報(bào)報(bào)報(bào)報(bào)1 1個(gè)個(gè)個(gè)個(gè)或或或或幾幾幾幾個(gè)個(gè)個(gè)個(gè)序序序序列列列列、喜喜喜喜歡歡歡歡利利利利用用用用WWWWWW呈呈呈呈報(bào)報(bào)報(bào)報(bào)方方方方式式式式、序序序序列列列列注注注注釋釋釋釋不不不不復(fù)復(fù)復(fù)復(fù)雜雜雜雜而而而而且且且且不不不不需需需需要要要要序序序序列列列列分分分分析析析析工工工工具具具具呈呈呈呈報(bào)報(bào)報(bào)報(bào)序序序序列列列列數(shù)據(jù)時(shí),可應(yīng)用數(shù)據(jù)時(shí),可應(yīng)用數(shù)據(jù)時(shí),可應(yīng)用數(shù)據(jù)時(shí),可應(yīng)用“BankItBankIt”工具。工具。工具。工具。NCBINCBI的的的的“Sequin”Sequin”(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/inhttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/index.htmldex.html)是向是向是向是向GenBankGenBank、EMBLEMBL或或或或DDBJDDBJ序列數(shù)據(jù)序列數(shù)據(jù)序列數(shù)據(jù)序列數(shù)據(jù)庫(kù)呈報(bào)與更新序列數(shù)據(jù)的獨(dú)立的工具軟件。它可以庫(kù)呈報(bào)與更新序列數(shù)據(jù)的獨(dú)立的工具軟件。它可以庫(kù)呈報(bào)與更新序列數(shù)據(jù)的獨(dú)立的工具軟件。它可以庫(kù)呈報(bào)與更新序列數(shù)據(jù)的獨(dú)立的工具軟件。它可以處理包含單個(gè)短的處理包含單個(gè)短的處理包含單個(gè)短的處理包含單個(gè)短的mRNAmRNA序列信息的簡(jiǎn)單呈報(bào)以及序列信息的簡(jiǎn)單呈報(bào)以及序列信息的簡(jiǎn)單呈報(bào)以及序列信息的簡(jiǎn)單呈報(bào)以及長(zhǎng)的序列、復(fù)雜的數(shù)據(jù)注釋、長(zhǎng)的序列、復(fù)雜的數(shù)據(jù)注釋、長(zhǎng)的序列、復(fù)雜的數(shù)據(jù)注釋、長(zhǎng)的序列、復(fù)雜的數(shù)據(jù)注釋、DNADNA片段組、物種來(lái)片段組、物種來(lái)片段組、物種來(lái)片段組、物種來(lái)源、種群研究的數(shù)據(jù)呈報(bào)。源、種群研究的數(shù)據(jù)呈報(bào)。源、種群研究的數(shù)據(jù)呈報(bào)。源、種群研究的數(shù)據(jù)呈報(bào)。該軟件及聯(lián)機(jī)幫助文件可通過(guò)匿名該軟件及聯(lián)機(jī)幫助文件可通過(guò)匿名該軟件及聯(lián)機(jī)幫助文件可通過(guò)匿名該軟件及聯(lián)機(jī)幫助文件可通過(guò)匿名FTPFTP(ftp:/ncbi.nlm.nih.gov/sequin/ftp:/ncbi.nlm.nih.gov/sequin/)獲得。適用于各獲得。適用于各獲得。適用于各獲得。適用于各類(lèi)型計(jì)算機(jī)的類(lèi)型計(jì)算機(jī)的類(lèi)型計(jì)算機(jī)的類(lèi)型計(jì)算機(jī)的SequinSequin軟件的下載方法與步驟可參見(jiàn)其下軟件的下載方法與步驟可參見(jiàn)其下軟件的下載方法與步驟可參見(jiàn)其下軟件的下載方法與步驟可參見(jiàn)其下載網(wǎng)頁(yè)載網(wǎng)頁(yè)載網(wǎng)頁(yè)載網(wǎng)頁(yè)(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/download.htmlhttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/download.html)。)。)。)。3)GenBank 3)GenBank 數(shù)據(jù)記錄的顯示格式數(shù)據(jù)記錄的顯示格式數(shù)據(jù)記錄的顯示格式數(shù)據(jù)記錄的顯示格式 在檢索結(jié)果顯示網(wǎng)頁(yè)的檢索結(jié)果列表中,可點(diǎn)擊收在檢索結(jié)果顯示網(wǎng)頁(yè)的檢索結(jié)果列表中,可點(diǎn)擊收在檢索結(jié)果顯示網(wǎng)頁(yè)的檢索結(jié)果列表中,可點(diǎn)擊收在檢索結(jié)果顯示網(wǎng)頁(yè)的檢索結(jié)果列表中,可點(diǎn)擊收錄登記號(hào)瀏覽各記錄的詳細(xì)內(nèi)容。和錄登記號(hào)瀏覽各記錄的詳細(xì)內(nèi)容。和錄登記號(hào)瀏覽各記錄的詳細(xì)內(nèi)容。和錄登記號(hào)瀏覽各記錄的詳細(xì)內(nèi)容。和PubMedPubMed相同,相同,相同,相同,通過(guò)選擇顯示格式和每頁(yè)顯示的記錄數(shù),然后點(diǎn)擊通過(guò)選擇顯示格式和每頁(yè)顯示的記錄數(shù),然后點(diǎn)擊通過(guò)選擇顯示格式和每頁(yè)顯示的記錄數(shù),然后點(diǎn)擊通過(guò)選擇顯示格式和每頁(yè)顯示的記錄數(shù),然后點(diǎn)擊下拉菜單按鈕,即可同時(shí)顯示多個(gè)記錄的核酸序列下拉菜單按鈕,即可同時(shí)顯示多個(gè)記錄的核酸序列下拉菜單按鈕,即可同時(shí)顯示多個(gè)記錄的核酸序列下拉菜單按鈕,即可同時(shí)顯示多個(gè)記錄的核酸序列詳細(xì)信息。在可選擇的顯示格式中,經(jīng)常選擇的有詳細(xì)信息。在可選擇的顯示格式中,經(jīng)常選擇的有詳細(xì)信息。在可選擇的顯示格式中,經(jīng)常選擇的有詳細(xì)信息。在可選擇的顯示格式中,經(jīng)常選擇的有GenBankGenBank和和和和FASTAFASTA兩種格式。兩種格式。兩種格式。兩種格式。如要對(duì)基因序列作進(jìn)一步分析,如要對(duì)基因序列作進(jìn)一步分析,如要對(duì)基因序列作進(jìn)一步分析,如要對(duì)基因序列作進(jìn)一步分析,F(xiàn)ASTAFASTA格式是很好格式是很好格式是很好格式是很好的選擇。的選擇。的選擇。的選擇。FASTAFASTA格式僅包括該序列的簡(jiǎn)要特征,并格式僅包括該序列的簡(jiǎn)要特征,并格式僅包括該序列的簡(jiǎn)要特征,并格式僅包括該序列的簡(jiǎn)要特征,并以以以以GG、A A、T T、C C四種堿基列出核苷酸序列,簡(jiǎn)單明四種堿基列出核苷酸序列,簡(jiǎn)單明四種堿基列出核苷酸序列,簡(jiǎn)單明四種堿基列出核苷酸序列,簡(jiǎn)單明了。而了。而了。而了。而GenBankGenBank格式可顯示較完整的基因序列記錄,格式可顯示較完整的基因序列記錄,格式可顯示較完整的基因序列記錄,格式可顯示較完整的基因序列記錄,反映核苷酸序列的詳細(xì)信息。反映核苷酸序列的詳細(xì)信息。反映核苷酸序列的詳細(xì)信息。反映核苷酸序列的詳細(xì)信息。NucleotideNucleotide數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)GenBankGenBank顯示格式序列特征副標(biāo)題含義顯示格式序列特征副標(biāo)題含義顯示格式序列特征副標(biāo)題含義顯示格式序列特征副標(biāo)題含義副標(biāo)題副標(biāo)題含含義義副標(biāo)題副標(biāo)題含含義義allele等位基因等位基因promoter啟動(dòng)子啟動(dòng)子attenuator弱化子弱化子Protein_bind蛋白結(jié)合區(qū)蛋白結(jié)合區(qū)CAAT-signal真真 核核 啟啟 動(dòng)動(dòng) 子子 的的CAAT-信號(hào)信號(hào)provirus原病毒序列原病毒序列CDScDNARBS核糖體結(jié)合位點(diǎn)核糖體結(jié)合位點(diǎn)Cellular胞質(zhì)胞質(zhì)DNArep_origion雙雙鏈鏈DNA復(fù)復(fù)制制起起始始區(qū)區(qū)Conflict不同測(cè)序的差異不同測(cè)序的差異repeat_region包包含含重重復(fù)復(fù)子子序序列列的的區(qū)域區(qū)域Enhancer增強(qiáng)子增強(qiáng)子rRNA核糖體核糖體RNAExon外顯子外顯子satellite衛(wèi)星重復(fù)序列衛(wèi)星重復(fù)序列Gc_signal真真 核核 啟啟 動(dòng)動(dòng) 子子 的的GC-信號(hào)信號(hào)sig_peptide編碼信號(hào)肽的序列編碼信號(hào)肽的序列Intron內(nèi)含子內(nèi)含子snRNA小核小核RNALTR長(zhǎng)長(zhǎng)末末端端重重復(fù)復(fù)序序列列TATA_signal真真 核核 啟啟 動(dòng)動(dòng) 子子 的的TATA-信號(hào)信號(hào)Mat-Peptide編編碼碼成成熟熟肽肽的的順序順序terminator轉(zhuǎn)錄終止序列轉(zhuǎn)錄終止序列mRNA信使信使RNAtRNA轉(zhuǎn)運(yùn)轉(zhuǎn)運(yùn)RNAMutation突變位點(diǎn)突變位點(diǎn)unsure不能確定的區(qū)域不能確定的區(qū)域polyA_sitemRNA的的polyA位置位置-10_signal原原 核核 啟啟 動(dòng)動(dòng) 子子Pribow-信號(hào)信號(hào)Precursor-RNA前體前體RNA-35_signal原原核核啟啟動(dòng)動(dòng)子子的的-35-信號(hào)信號(hào)Prim_transcript初始轉(zhuǎn)錄物初始轉(zhuǎn)錄物3UTR3非翻譯區(qū)非翻譯區(qū)PrimerPCR引物引物5UTR5非翻譯區(qū)非翻譯區(qū)生物分子序列核心數(shù)據(jù)庫(kù)生物分子序列核心數(shù)據(jù)庫(kù)UniProt/SWISS-PROT/蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)主講教師:趙雨杰主講教師:趙雨杰UniProt/SWISS-PROT/UniProt/SWISS-PROT/蛋白質(zhì)序列蛋白質(zhì)序列蛋白質(zhì)序列蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)SWISS-PROTSWISS-PROT(http:/www.expasy.ch/sprot/http:/www.expasy.ch/sprot/)是蛋白是蛋白是蛋白是蛋白質(zhì)序列注釋性知識(shí)數(shù)據(jù)庫(kù),創(chuàng)建于質(zhì)序列注釋性知識(shí)數(shù)據(jù)庫(kù),創(chuàng)建于質(zhì)序列注釋性知識(shí)數(shù)據(jù)庫(kù),創(chuàng)建于質(zhì)序列注釋性知識(shí)數(shù)據(jù)庫(kù),創(chuàng)建于19861986年,由瑞士生物年,由瑞士生物年,由瑞士生物年,由瑞士生物信息學(xué)研究所信息學(xué)研究所信息學(xué)研究所信息學(xué)研究所(SwissInstituteforBioinformatics,SIB)SwissInstituteforBioinformatics,SIB)和歐洲生物信息學(xué)研究所(和歐洲生物信息學(xué)研究所(和歐洲生物信息學(xué)研究所(和歐洲生物信息學(xué)研究所(EuropeanBioinformaticEuropeanBioinformaticInstitute,EBIInstitute,EBI)共同協(xié)作維護(hù)。共同協(xié)作維護(hù)。共同協(xié)作維護(hù)。共同協(xié)作維護(hù)。WebWeb上有多個(gè)站點(diǎn)可進(jìn)入并檢索該數(shù)據(jù)庫(kù)。其主要上有多個(gè)站點(diǎn)可進(jìn)入并檢索該數(shù)據(jù)庫(kù)。其主要上有多個(gè)站點(diǎn)可進(jìn)入并檢索該數(shù)據(jù)庫(kù)。其主要上有多個(gè)站點(diǎn)可進(jìn)入并檢索該數(shù)據(jù)庫(kù)。其主要站點(diǎn)有站點(diǎn)有站點(diǎn)有站點(diǎn)有ExPASyExPASy分子生物學(xué)網(wǎng)站分子生物學(xué)網(wǎng)站分子生物學(xué)網(wǎng)站分子生物學(xué)網(wǎng)站(http:/www.expasy.ch/sprot/)http:/www.expasy.ch/sprot/)和歐洲生物信息學(xué)和歐洲生物信息學(xué)和歐洲生物信息學(xué)和歐洲生物信息學(xué)研究所(研究所(研究所(研究所(EBIEBI)網(wǎng)站網(wǎng)站網(wǎng)站網(wǎng)站(http:/www.ebi.ac.uk/uniprothttp:/www.ebi.ac.uk/uniprot)等。)等。)等。)等。ExPASyExPASy網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)站上的站上的站上的站上的SWISS-PROT/TrEMBLSWISS-PROT/TrEMBL數(shù)據(jù)庫(kù)訪問(wèn)界面數(shù)據(jù)庫(kù)訪問(wèn)界面數(shù)據(jù)庫(kù)訪問(wèn)界面數(shù)據(jù)庫(kù)訪問(wèn)界面。UniProtKBUniProtKB數(shù)據(jù)庫(kù)與其它蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)與其它蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)與其它蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)與其它蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)的區(qū)別序列數(shù)據(jù)庫(kù)的區(qū)別序列數(shù)據(jù)庫(kù)的區(qū)別序列數(shù)據(jù)庫(kù)的區(qū)別 提提提提供供供供蛋蛋蛋蛋白白白白質(zhì)質(zhì)質(zhì)質(zhì)序序序序列列列列的的的的詳詳詳詳盡盡盡盡注注注注釋釋釋釋信信信信息息息息。序序序序列列列列注注注注釋釋釋釋包包包包括括括括蛋蛋蛋蛋白白白白質(zhì)質(zhì)質(zhì)質(zhì)功功功功能能能能、蛋蛋蛋蛋白白白白質(zhì)質(zhì)質(zhì)質(zhì)翻翻翻翻譯譯譯譯后后后后修修修修飾飾飾飾、結(jié)結(jié)結(jié)結(jié)構(gòu)構(gòu)構(gòu)構(gòu)域域域域和和和和結(jié)結(jié)結(jié)結(jié)合合合合位位位位點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)、二二二二級(jí)級(jí)級(jí)級(jí)結(jié)結(jié)結(jié)結(jié)構(gòu)構(gòu)構(gòu)構(gòu)、三三三三級(jí)級(jí)級(jí)級(jí)結(jié)結(jié)結(jié)結(jié)構(gòu)構(gòu)構(gòu)構(gòu)、與與與與其其其其它它它它蛋蛋蛋蛋白白白白質(zhì)質(zhì)質(zhì)質(zhì)的的的的相相相相似性、蛋白質(zhì)缺陷相關(guān)疾病等信息。似性、蛋白質(zhì)缺陷相關(guān)疾病等信息。似性、蛋白質(zhì)缺陷相關(guān)疾病等信息。似性、蛋白質(zhì)缺陷相關(guān)疾病等信息。避免過(guò)多的重復(fù)。許多序列數(shù)據(jù)庫(kù)中,對(duì)于一種特避免過(guò)多的重復(fù)。許多序列數(shù)據(jù)庫(kù)中,對(duì)于一種特避免過(guò)多的重復(fù)。許多序列數(shù)據(jù)庫(kù)中,對(duì)于一種特避免過(guò)多的重復(fù)。許多序列數(shù)據(jù)庫(kù)中,對(duì)于一種特定的蛋白質(zhì)序列,對(duì)應(yīng)不同的文獻(xiàn)報(bào)告有不同的序定的蛋白質(zhì)序列,對(duì)應(yīng)不同的文獻(xiàn)報(bào)告有不同的序定的蛋白質(zhì)序列,對(duì)應(yīng)不同的文獻(xiàn)報(bào)告有不同的序定的蛋白質(zhì)序列,對(duì)應(yīng)不同的文獻(xiàn)報(bào)告有不同的序列記錄。而在列記錄。而在列記錄。而在列記錄。而在SWISS-PROTSWISS-PROT中,盡量避免過(guò)多的重中,盡量避免過(guò)多的重中,盡量避免過(guò)多的重中,盡量避免過(guò)多的重復(fù)。對(duì)同種蛋白質(zhì)的多個(gè)記錄進(jìn)行仔細(xì)比較后歸結(jié)復(fù)。對(duì)同種蛋白質(zhì)的多個(gè)記錄進(jìn)行仔細(xì)比較后歸結(jié)復(fù)。對(duì)同種蛋白質(zhì)的多個(gè)記錄進(jìn)行仔細(xì)比較后歸結(jié)復(fù)。對(duì)同種蛋白質(zhì)的多個(gè)記錄進(jìn)行仔細(xì)比較后歸結(jié)到一個(gè)記錄內(nèi),方便了用戶檢索利用。到一個(gè)記錄內(nèi),方便了用戶檢索利用。到一個(gè)記錄內(nèi),方便了用戶檢索利用。到一個(gè)記錄內(nèi),方便了用戶檢索利用。與其它數(shù)據(jù)庫(kù)相結(jié)合。與其它數(shù)據(jù)庫(kù)相結(jié)合。與其它數(shù)據(jù)庫(kù)相結(jié)合。與其它數(shù)據(jù)庫(kù)相結(jié)合。SWISS-PROTSWISS-PROT數(shù)據(jù)庫(kù)與其它數(shù)據(jù)庫(kù)與其它數(shù)據(jù)庫(kù)與其它數(shù)據(jù)庫(kù)與其它3030種不同的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行交叉參考種不同的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行交叉參考種不同的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行交叉參考種不同的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行交叉參考,可以同時(shí)獲得蛋白可以同時(shí)獲得蛋白可以同時(shí)獲得蛋白可以同時(shí)獲得蛋白質(zhì)的各方面資料。此外,質(zhì)的各方面資料。此外,質(zhì)的各方面資料。此外,質(zhì)的各方面資料。此外,SWISS-PROTSWISS-PROT還提供蛋白還提供蛋白還提供蛋白還提供蛋白質(zhì)組(質(zhì)組(質(zhì)組(質(zhì)組(PROTEincomplementtoagenOMEPROTEincomplementtoagenOME,PROTEOMEPROTEOME)信息和信息和信息和信息和TrEMBLTrEMBL信息。信息。信息。信息。SWISS-PROTSWISS-PROT記錄顯示格式很規(guī)范,字段名運(yùn)用兩記錄顯示格式很規(guī)范,字段名運(yùn)用兩記錄顯示格式很規(guī)范,字段名運(yùn)用兩記錄顯示格式很規(guī)范,字段名運(yùn)用兩位字母代碼表示。位字母代碼表示。位字母代碼表示。位字母代碼表示。SWISS-PROTSWISS-PROT記錄字段及含義記錄字段及含義UniProtKBUniProtKB數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索 進(jìn)入進(jìn)入進(jìn)入進(jìn)入U(xiǎn)niProtKBUniProtKB首頁(yè)(首頁(yè)(首頁(yè)(首頁(yè)(http:/www.uniprot.org/http:/www.uniprot.org/),可在檢索窗口內(nèi)輸入檢索詞進(jìn)行一般性檢索可在檢索窗口內(nèi)輸入檢索詞進(jìn)行一般性檢索可在檢索窗口內(nèi)輸入檢索詞進(jìn)行一般性檢索可在檢索窗口內(nèi)輸入檢索詞進(jìn)行一般性檢索(QuickSearchQuickSearch)。這些檢索詞可以是:登記號(hào))。這些檢索詞可以是:登記號(hào))。這些檢索詞可以是:登記號(hào))。這些檢索詞可以是:登記號(hào)(AC)(AC)、標(biāo)識(shí)號(hào)、標(biāo)識(shí)號(hào)、標(biāo)識(shí)號(hào)、標(biāo)識(shí)號(hào)(ID)(ID)、序列描述內(nèi)容(、序列描述內(nèi)容(、序列描述內(nèi)容(、序列描述內(nèi)容(DescriptionDescription)、)、)、)、基因名稱(chēng)(基因名稱(chēng)(基因名稱(chēng)(基因名稱(chēng)(GenenameGenename)、物種名稱(chēng))、物種名稱(chēng))、物種名稱(chēng))、物種名稱(chēng)(Organism)(Organism)等等等等字段中的詞匯。字段中的詞匯。字段中的詞匯。字段中的詞匯。在在在在該該該該界界界界面面面面的的的的檢檢檢檢索索索索窗窗窗窗口口口口內(nèi)內(nèi)內(nèi)內(nèi),可可可可以以以以輸輸輸輸入入入入:ACAC、IDID、DEDE、GNGN、OSOS、OCOC、RXRX、RCRC、RARA、RLRL、CCCC、DRDR、KWKW、FTFT字字字字段段段段中中中中的的的的任任任任意意意意詞詞詞詞。輸輸輸輸入入入入的的的的檢檢檢檢索索索索詞詞詞詞應(yīng)應(yīng)應(yīng)應(yīng)區(qū)區(qū)區(qū)區(qū)分分分分大大大大小小小小 寫(xiě)寫(xiě)寫(xiě)寫(xiě)。如如如如 果果果果 選選選選 定定定定 檢檢檢檢 索索索索 窗窗窗窗 口口口口 下下下下 方方方方 的的的的“PrefixPrefix andandappendappendwildcardwildcard*totowordswords”(前前前前綴綴綴綴及及及及詞詞詞詞上上上上添添添添加加加加通通通通配配配配符符符符*)復(fù)復(fù)復(fù)復(fù)選選選選框框框框,還還還還可可可可以以以以將將將將輸輸輸輸入入入入的的的的檢檢檢檢索索索索詞詞詞詞作作作作為為為為前前前前綴或詞的一部分進(jìn)行擴(kuò)展檢索。綴或詞的一部分進(jìn)行擴(kuò)展檢索。綴或詞的一部分進(jìn)行擴(kuò)展檢索。綴或詞的一部分進(jìn)行擴(kuò)展檢索。例如:輸入檢索詞例如:輸入檢索詞例如:輸入檢索詞例如:輸入檢索詞aldehydealdehyde。當(dāng)不選用通配符時(shí),當(dāng)不選用通配符時(shí),當(dāng)不選用通配符時(shí),當(dāng)不選用通配符時(shí),則只檢索完全符合則只檢索完全符合則只檢索完全符合則只檢索完全符合“aldehydealdehyde”一詞的結(jié)果;當(dāng)選一詞的結(jié)果;當(dāng)選一詞的結(jié)果;當(dāng)選一詞的結(jié)果;當(dāng)選擇復(fù)選框時(shí),則可檢索出:擇復(fù)選框時(shí),則可檢索出:擇復(fù)選框時(shí),則可檢索出:擇復(fù)選框時(shí),則可檢索出:aldehydealdehyde、glyceraldehydeglyceraldehyde、lactaldehydelactaldehyde、aspartate-aspartate-semialdehydesemialdehyde等等包含等等包含等等包含等等包含“aldehydealdehyde”的所有詞匯。的所有詞匯。的所有詞匯。的所有詞匯。當(dāng)當(dāng)當(dāng)當(dāng)同同同同時(shí)時(shí)時(shí)時(shí)輸輸輸輸入入入入多多多多個(gè)個(gè)個(gè)個(gè)檢檢檢檢索索索索詞詞詞詞時(shí)時(shí)時(shí)時(shí),則則則則可可可可利利利利用用用用邏邏邏邏輯輯輯輯運(yùn)運(yùn)運(yùn)運(yùn)算算算算符符符符(AND,OR,NOTAND,OR,NOT)及及及及大大大大括括括括號(hào)號(hào)號(hào)號(hào)“”、“”來(lái)來(lái)來(lái)來(lái)限限限限定定定定檢檢檢檢索索索索。需需需需注注注注意意意意,此此此此處處處處不不不不可可可可以以以以用用用用括括括括號(hào)號(hào)號(hào)號(hào),因因因因?yàn)闉闉闉槔ɡɡɡㄌ?hào)號(hào)號(hào)號(hào)可可可可以以以以作作作作為為為為 檢檢檢檢 索索索索 詞詞詞詞 的的的的 一一一一 部部部部 分分分分。檢檢檢檢 索索索索 舉舉舉舉 例例例例:“colicoli ANDANDatpaseatpaseORORatpatpsynthetasesynthetase”,該該該該檢檢檢檢索索索索式式式式可可可可獲獲獲獲得得得得包包包包含含含含“colicoli”,同同同同 時(shí)時(shí)時(shí)時(shí) 還還還還 包包包包 含含含含“atpaseatpase”或或或或“atpatpsynthetasesynthetase”的記錄。的記錄。的記錄。的記錄。登記號(hào)或標(biāo)識(shí)號(hào)(登記號(hào)或標(biāo)識(shí)號(hào)(登記號(hào)或標(biāo)識(shí)號(hào)(登記號(hào)或標(biāo)識(shí)號(hào)(ACAC或或或或IDID)途徑檢索:進(jìn)入登記號(hào))途徑檢索:進(jìn)入登記號(hào))途徑檢索:進(jìn)入登記號(hào))途徑檢索:進(jìn)入登記號(hào)檢索界面后,可在檢索窗口內(nèi)輸入登記號(hào)或標(biāo)識(shí)號(hào)檢索界面后,可在檢索窗口內(nèi)輸入登記號(hào)或標(biāo)識(shí)號(hào)檢索界面后,可在檢索窗口內(nèi)輸入登記號(hào)或標(biāo)識(shí)號(hào)檢索界面后,可在檢索窗口內(nèi)輸入登記號(hào)或標(biāo)識(shí)號(hào)進(jìn)行檢索。如:進(jìn)行檢索。如:進(jìn)行檢索。如:進(jìn)行檢索。如:P04406,
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生物信息學(xué)
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