生物信息學(xué)本科教學(xué)課件
生物信息學(xué)本科教學(xué)課件,生物信息學(xué),本科教學(xué)課件,生物,信息學(xué),本科,教學(xué),課件
Internet基礎(chǔ)基礎(chǔ)主講教師:趙雨杰主講教師:趙雨杰Internet Internet 基礎(chǔ)基礎(chǔ)基礎(chǔ)基礎(chǔ) 生生生生物物物物信信信信息息息息學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)是是是是一一一一門門門門新新新新興興興興的的的的并并并并正正正正在在在在迅迅迅迅速速速速發(fā)發(fā)發(fā)發(fā)展展展展的的的的交交交交叉叉叉叉學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)科科科科,是是是是生生生生命命命命科科科科學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)和和和和信信信信息息息息科科科科學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)尤尤尤尤其其其其是是是是分分分分子子子子生生生生物物物物學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)與與與與計(jì)計(jì)計(jì)計(jì)算算算算機(jī)機(jī)機(jī)機(jī)信信信信息息息息處處處處理理理理技技技技術(shù)術(shù)術(shù)術(shù)相相相相結(jié)結(jié)結(jié)結(jié)合合合合而而而而形形形形成成成成的的的的交交交交叉叉叉叉學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)科科科科,是是是是采采采采用用用用數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)、統(tǒng)統(tǒng)統(tǒng)統(tǒng)計(jì)計(jì)計(jì)計(jì)學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)和和和和計(jì)計(jì)計(jì)計(jì)算算算算機(jī)機(jī)機(jī)機(jī)方方方方法法法法對(duì)對(duì)對(duì)對(duì)生生生生物物物物學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)信信信信息進(jìn)行采集、存儲(chǔ)、息進(jìn)行采集、存儲(chǔ)、息進(jìn)行采集、存儲(chǔ)、息進(jìn)行采集、存儲(chǔ)、傳播傳播傳播傳播、分析、解釋的科學(xué)。、分析、解釋的科學(xué)。、分析、解釋的科學(xué)。、分析、解釋的科學(xué)。生生生生物物物物信信信信息息息息學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)涉涉涉涉及及及及生生生生物物物物學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)、計(jì)計(jì)計(jì)計(jì)算算算算機(jī)機(jī)機(jī)機(jī)科科科科學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)、數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)、統(tǒng)統(tǒng)統(tǒng)統(tǒng)計(jì)計(jì)計(jì)計(jì)學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)、醫(yī)醫(yī)醫(yī)醫(yī)學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)、化化化化學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)等等等等眾眾眾眾多多多多學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)科科科科不不不不同同同同研研研研究究究究方方方方向向向向的的的的研研研研究究究究人人人人員員員員,其其其其共共共共同同同同點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)在在在在于于于于任任任任何何何何類類類類別別別別的的的的數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)皆皆皆皆依依依依賴賴賴賴于于于于計(jì)計(jì)計(jì)計(jì)算算算算機(jī)機(jī)機(jī)機(jī)處處處處理理理理、存存存存儲(chǔ)儲(chǔ)儲(chǔ)儲(chǔ)、分分分分析析析析。InternetInternet網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)絡(luò)絡(luò)絡(luò)絡(luò)是是是是信信信信息息息息傳傳傳傳輸輸輸輸、檢檢檢檢索索索索、獲獲獲獲取取取取、交交交交流流流流的的的的重重重重要要要要手手手手段段段段。因因因因此此此此,InternetInternet的的的的應(yīng)應(yīng)應(yīng)應(yīng)用是生物信息學(xué)研究的用是生物信息學(xué)研究的用是生物信息學(xué)研究的用是生物信息學(xué)研究的關(guān)鍵關(guān)鍵關(guān)鍵關(guān)鍵。InternetInternet不不不不是是是是單單單單一一一一的的的的計(jì)計(jì)計(jì)計(jì)算算算算機(jī)機(jī)機(jī)機(jī)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)絡(luò)絡(luò)絡(luò)絡(luò),而而而而是是是是建建建建立立立立在在在在計(jì)計(jì)計(jì)計(jì)算算算算機(jī)機(jī)機(jī)機(jī)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)絡(luò)絡(luò)絡(luò)絡(luò)之之之之上上上上的的的的網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)絡(luò)絡(luò)絡(luò)絡(luò),是是是是通通通通過(guò)過(guò)過(guò)過(guò)同同同同一一一一組組組組計(jì)計(jì)計(jì)計(jì)算算算算機(jī)機(jī)機(jī)機(jī)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)絡(luò)絡(luò)絡(luò)絡(luò)通通通通信信信信協(xié)協(xié)協(xié)協(xié)議議議議-即即即即TCP/IPTCP/IP(Internet Internet Control Control Protocol/Internet Protocol/Internet ProtocolProtocol)將將將將許許許許多多多多計(jì)計(jì)計(jì)計(jì)算算算算機(jī)機(jī)機(jī)機(jī)局局局局域域域域網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)連連連連接接接接起起起起來(lái)來(lái)來(lái)來(lái)形形形形成成成成的的的的巨巨巨巨型型型型計(jì)計(jì)計(jì)計(jì)算算算算機(jī)機(jī)機(jī)機(jī)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)絡(luò)絡(luò)絡(luò)絡(luò)。國(guó)國(guó)國(guó)國(guó)內(nèi)內(nèi)內(nèi)內(nèi)對(duì)對(duì)對(duì)對(duì)InternetInternet的的的的稱稱稱稱謂有很多,如:因特網(wǎng)、國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)、交互網(wǎng)等。謂有很多,如:因特網(wǎng)、國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)、交互網(wǎng)等。謂有很多,如:因特網(wǎng)、國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)、交互網(wǎng)等。謂有很多,如:因特網(wǎng)、國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)、交互網(wǎng)等。因因因因特特特特網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)從從從從2020世世世世紀(jì)紀(jì)紀(jì)紀(jì)6060年年年年代代代代末末末末誕誕誕誕生生生生到到到到8080年年年年代代代代網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)絡(luò)絡(luò)絡(luò)絡(luò)的的的的基基基基本本本本形形形形成成成成,目目目目前前前前已已已已經(jīng)經(jīng)經(jīng)經(jīng)發(fā)發(fā)發(fā)發(fā)展展展展為為為為連連連連接接接接世世世世界界界界上上上上近近近近3 30000多多多多個(gè)個(gè)個(gè)個(gè)國(guó)國(guó)國(guó)國(guó)家家家家和和和和地地地地區(qū)區(qū)區(qū)區(qū)的的的的國(guó)國(guó)國(guó)國(guó)際際際際性性性性網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)絡(luò)絡(luò)絡(luò)絡(luò)。作作作作為為為為一一一一種種種種新新新新的的的的信信信信息息息息傳傳傳傳播播播播媒媒媒媒體體體體,因因因因特特特特網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)以以以以其其其其信信信信息息息息量量量量大大大大、數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)更更更更新新新新迅迅迅迅速速速速、文文文文件件件件傳傳傳傳輸輸輸輸速速速速度度度度快快快快、使使使使用用用用方方方方法法法法簡(jiǎn)簡(jiǎn)簡(jiǎn)簡(jiǎn)便便便便等等等等諸諸諸諸多多多多特特特特點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)而而而而已已已已經(jīng)經(jīng)經(jīng)經(jīng)成成成成為為為為科科科科研人員獲取最新科技信息的主要途徑研人員獲取最新科技信息的主要途徑研人員獲取最新科技信息的主要途徑研人員獲取最新科技信息的主要途徑。Internet Internet 功能功能功能功能1 1.信息的獲取與發(fā)布信息的獲取與發(fā)布信息的獲取與發(fā)布信息的獲取與發(fā)布:書庫(kù)、圖書館、雜志期刊、報(bào)紙,政府、公司、學(xué)書庫(kù)、圖書館、雜志期刊、報(bào)紙,政府、公司、學(xué)書庫(kù)、圖書館、雜志期刊、報(bào)紙,政府、公司、學(xué)書庫(kù)、圖書館、雜志期刊、報(bào)紙,政府、公司、學(xué) 校信息和各種不同的社會(huì)信息。校信息和各種不同的社會(huì)信息。校信息和各種不同的社會(huì)信息。校信息和各種不同的社會(huì)信息。2.2.電子郵件(電子郵件(電子郵件(電子郵件(E-mailE-mail):3.3.網(wǎng)上交際網(wǎng)上交際網(wǎng)上交際網(wǎng)上交際 :聊天、交友、玩網(wǎng)絡(luò)游戲等。聊天、交友、玩網(wǎng)絡(luò)游戲等。聊天、交友、玩網(wǎng)絡(luò)游戲等。聊天、交友、玩網(wǎng)絡(luò)游戲等。4.4.電子商務(wù)電子商務(wù)電子商務(wù)電子商務(wù) :網(wǎng)上購(gòu)物、網(wǎng)上商品銷售、網(wǎng)上拍賣、網(wǎng)上貨幣支付等網(wǎng)上購(gòu)物、網(wǎng)上商品銷售、網(wǎng)上拍賣、網(wǎng)上貨幣支付等網(wǎng)上購(gòu)物、網(wǎng)上商品銷售、網(wǎng)上拍賣、網(wǎng)上貨幣支付等網(wǎng)上購(gòu)物、網(wǎng)上商品銷售、網(wǎng)上拍賣、網(wǎng)上貨幣支付等 5.5.網(wǎng)絡(luò)電話網(wǎng)絡(luò)電話網(wǎng)絡(luò)電話網(wǎng)絡(luò)電話 :IP IP電話服務(wù)、視頻電話。電話服務(wù)、視頻電話。電話服務(wù)、視頻電話。電話服務(wù)、視頻電話。6.6.網(wǎng)上事務(wù)處理網(wǎng)上事務(wù)處理網(wǎng)上事務(wù)處理網(wǎng)上事務(wù)處理 :辦公自動(dòng)化。辦公自動(dòng)化。辦公自動(dòng)化。辦公自動(dòng)化。7.7.遠(yuǎn)程服務(wù):遠(yuǎn)程服務(wù):遠(yuǎn)程服務(wù):遠(yuǎn)程服務(wù):遠(yuǎn)程教育、遠(yuǎn)程醫(yī)療、遠(yuǎn)程主機(jī)登陸、遠(yuǎn)程文件傳輸。遠(yuǎn)程教育、遠(yuǎn)程醫(yī)療、遠(yuǎn)程主機(jī)登陸、遠(yuǎn)程文件傳輸。遠(yuǎn)程教育、遠(yuǎn)程醫(yī)療、遠(yuǎn)程主機(jī)登陸、遠(yuǎn)程文件傳輸。遠(yuǎn)程教育、遠(yuǎn)程醫(yī)療、遠(yuǎn)程主機(jī)登陸、遠(yuǎn)程文件傳輸。http:/ 1、PubMedPubMed簡(jiǎn)介簡(jiǎn)介簡(jiǎn)介簡(jiǎn)介MEDLINEMEDLINE(Medical Literature Analysis and Medical Literature Analysis and Retrieval System OnlineRetrieval System Online)是國(guó)際權(quán)威生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn))是國(guó)際權(quán)威生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn))是國(guó)際權(quán)威生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn))是國(guó)際權(quán)威生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù),生命科學(xué)主要是生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域相關(guān)文獻(xiàn)的數(shù)據(jù)庫(kù),生命科學(xué)主要是生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域相關(guān)文獻(xiàn)的數(shù)據(jù)庫(kù),生命科學(xué)主要是生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域相關(guān)文獻(xiàn)的數(shù)據(jù)庫(kù),生命科學(xué)主要是生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域相關(guān)文獻(xiàn)的主要檢索數(shù)據(jù)庫(kù)。內(nèi)容主要檢索數(shù)據(jù)庫(kù)。內(nèi)容主要檢索數(shù)據(jù)庫(kù)。內(nèi)容主要檢索數(shù)據(jù)庫(kù)。內(nèi)容涉及涉及涉及涉及生物學(xué)、醫(yī)學(xué)生物學(xué)、醫(yī)學(xué)生物學(xué)、醫(yī)學(xué)生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、護(hù)理學(xué)、護(hù)理學(xué)、護(hù)理學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、衛(wèi)生保健口腔醫(yī)學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、衛(wèi)生保健口腔醫(yī)學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、衛(wèi)生保健口腔醫(yī)學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、衛(wèi)生保健系統(tǒng)等系統(tǒng)等系統(tǒng)等系統(tǒng)等。該數(shù)據(jù)庫(kù)是由美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館(該數(shù)據(jù)庫(kù)是由美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館(該數(shù)據(jù)庫(kù)是由美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館(該數(shù)據(jù)庫(kù)是由美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館(National National Library of Medicine,NLMLibrary of Medicine,NLM)建立的,現(xiàn)收錄全世界)建立的,現(xiàn)收錄全世界)建立的,現(xiàn)收錄全世界)建立的,現(xiàn)收錄全世界7070多個(gè)國(guó)家出版的多個(gè)國(guó)家出版的多個(gè)國(guó)家出版的多個(gè)國(guó)家出版的4040多個(gè)語(yǔ)種的生物醫(yī)學(xué)期刊多個(gè)語(yǔ)種的生物醫(yī)學(xué)期刊多個(gè)語(yǔ)種的生物醫(yī)學(xué)期刊多個(gè)語(yǔ)種的生物醫(yī)學(xué)期刊5,6005,600多種。多種。多種。多種。InternetInternet網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)上上上上有有有有許許許許多多多多網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)網(wǎng)站站站站提提提提供供供供免免免免費(fèi)費(fèi)費(fèi)費(fèi)MEDLINEMEDLINE檢檢檢檢索索索索服服服服務(wù)務(wù)務(wù)務(wù),有有有有些些些些需需需需要要要要用用用用戶戶戶戶免免免免費(fèi)費(fèi)費(fèi)費(fèi)登登登登記記記記注注注注冊(cè)冊(cè)冊(cè)冊(cè)后后后后使使使使用用用用,如如如如:MedscapeMedscape、BioMedNetBioMedNet等等等等。有有有有些些些些不不不不需需需需要要要要用用用用戶戶戶戶登登登登記記記記即即即即可可可可直直直直接接接接利利利利用用用用,如如如如:美美美美國(guó)國(guó)國(guó)國(guó)國(guó)國(guó)國(guó)國(guó)立立立立醫(yī)醫(yī)醫(yī)醫(yī)學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)圖圖圖圖書書書書館館館館的的的的Entrez-Entrez-PubMedPubMed等等等等。19971997年年年年6 6月月月月起起起起,美美美美國(guó)國(guó)國(guó)國(guó)國(guó)國(guó)國(guó)國(guó)立立立立醫(yī)醫(yī)醫(yī)醫(yī)學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)圖圖圖圖書書書書館館館館將將將將MEDLINEMEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)通過(guò)InternetInternet免費(fèi)向網(wǎng)上用戶開(kāi)放免費(fèi)向網(wǎng)上用戶開(kāi)放免費(fèi)向網(wǎng)上用戶開(kāi)放免費(fèi)向網(wǎng)上用戶開(kāi)放。EntrezEntrez(http:/www.ncbi.nim.nih.gov/entrezhttp:/www.ncbi.nim.nih.gov/entrez)是)是)是)是美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館國(guó)家生物技術(shù)信息中心美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館國(guó)家生物技術(shù)信息中心美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館國(guó)家生物技術(shù)信息中心美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NationalCenterforBiotechnologyNationalCenterforBiotechnologyInformation,NCBIInformation,NCBI)建立的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)集成檢)建立的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)集成檢)建立的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)集成檢)建立的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)集成檢索系統(tǒng)。索系統(tǒng)。索系統(tǒng)。索系統(tǒng)。系統(tǒng)中的數(shù)據(jù)庫(kù)包括健康相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)、基因組數(shù)據(jù)系統(tǒng)中的數(shù)據(jù)庫(kù)包括健康相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)、基因組數(shù)據(jù)系統(tǒng)中的數(shù)據(jù)庫(kù)包括健康相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)、基因組數(shù)據(jù)系統(tǒng)中的數(shù)據(jù)庫(kù)包括健康相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)、基因組數(shù)據(jù)庫(kù)、基因數(shù)據(jù)庫(kù)、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)、化學(xué)及文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)、基因數(shù)據(jù)庫(kù)、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)、化學(xué)及文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)、基因數(shù)據(jù)庫(kù)、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)、化學(xué)及文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)、基因數(shù)據(jù)庫(kù)、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)、化學(xué)及文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù),包括通過(guò)庫(kù),包括通過(guò)庫(kù),包括通過(guò)庫(kù),包括通過(guò)PubMedPubMed檢索的檢索的檢索的檢索的MEDLINEMEDLINE。EntrezEntrez集集集集成系統(tǒng)的最大特點(diǎn)是通過(guò)任何一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索出的成系統(tǒng)的最大特點(diǎn)是通過(guò)任何一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索出的成系統(tǒng)的最大特點(diǎn)是通過(guò)任何一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索出的成系統(tǒng)的最大特點(diǎn)是通過(guò)任何一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索出的信息可直接鏈接到信息可直接鏈接到信息可直接鏈接到信息可直接鏈接到EntrezEntrez其它數(shù)據(jù)庫(kù)并找到相關(guān)的其它數(shù)據(jù)庫(kù)并找到相關(guān)的其它數(shù)據(jù)庫(kù)并找到相關(guān)的其它數(shù)據(jù)庫(kù)并找到相關(guān)的檢索結(jié)果。檢索結(jié)果。檢索結(jié)果。檢索結(jié)果。NCBI網(wǎng)址:http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMedPubMed包含包含包含包含MEDLINEMEDLINE數(shù)據(jù)、在加工數(shù)據(jù)(也稱為數(shù)據(jù)、在加工數(shù)據(jù)(也稱為數(shù)據(jù)、在加工數(shù)據(jù)(也稱為數(shù)據(jù)、在加工數(shù)據(jù)(也稱為PreMEDLINEPreMEDLINE)和出版商提供的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)。)和出版商提供的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)。)和出版商提供的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)。)和出版商提供的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)。PubMedPubMed的在加工數(shù)據(jù)是在文獻(xiàn)被標(biāo)引醫(yī)學(xué)主題詞的在加工數(shù)據(jù)是在文獻(xiàn)被標(biāo)引醫(yī)學(xué)主題詞的在加工數(shù)據(jù)是在文獻(xiàn)被標(biāo)引醫(yī)學(xué)主題詞的在加工數(shù)據(jù)是在文獻(xiàn)被標(biāo)引醫(yī)學(xué)主題詞(MedicalSubjectHeadings,MeSHMedicalSubjectHeadings,MeSH)并正式進(jìn))并正式進(jìn))并正式進(jìn))并正式進(jìn)入入入入MEDLINEMEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)之前的臨時(shí)數(shù)據(jù)庫(kù),提供文獻(xiàn)的數(shù)據(jù)庫(kù)之前的臨時(shí)數(shù)據(jù)庫(kù),提供文獻(xiàn)的數(shù)據(jù)庫(kù)之前的臨時(shí)數(shù)據(jù)庫(kù),提供文獻(xiàn)的數(shù)據(jù)庫(kù)之前的臨時(shí)數(shù)據(jù)庫(kù),提供文獻(xiàn)的基本信息和文獻(xiàn)摘要?;拘畔⒑臀墨I(xiàn)摘要。基本信息和文獻(xiàn)摘要?;拘畔⒑臀墨I(xiàn)摘要。PubMedPubMed在工作日內(nèi)每天對(duì)該數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行更新,在工作日內(nèi)每天對(duì)該數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行更新,在工作日內(nèi)每天對(duì)該數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行更新,在工作日內(nèi)每天對(duì)該數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行更新,加入新的文獻(xiàn)記錄,并在記錄上標(biāo)明加入新的文獻(xiàn)記錄,并在記錄上標(biāo)明加入新的文獻(xiàn)記錄,并在記錄上標(biāo)明加入新的文獻(xiàn)記錄,并在記錄上標(biāo)明“PubMed-PubMed-inprocess”inprocess”。因?yàn)閯偧尤胛墨I(xiàn)數(shù)據(jù)未被標(biāo)引主。因?yàn)閯偧尤胛墨I(xiàn)數(shù)據(jù)未被標(biāo)引主。因?yàn)閯偧尤胛墨I(xiàn)數(shù)據(jù)未被標(biāo)引主。因?yàn)閯偧尤胛墨I(xiàn)數(shù)據(jù)未被標(biāo)引主題詞,所以檢索時(shí)可利用自由詞途徑檢索而不能題詞,所以檢索時(shí)可利用自由詞途徑檢索而不能題詞,所以檢索時(shí)可利用自由詞途徑檢索而不能題詞,所以檢索時(shí)可利用自由詞途徑檢索而不能用主題詞途徑檢索。用主題詞途徑檢索。用主題詞途徑檢索。用主題詞途徑檢索。PubMed的一般檢索方法的一般檢索方法主講教師:趙雨杰主講教師:趙雨杰2 2、PubMedPubMed的一般檢索方法的一般檢索方法的一般檢索方法的一般檢索方法通過(guò)通過(guò)通過(guò)通過(guò)NCBINCBI首頁(yè)(首頁(yè)(首頁(yè)(首頁(yè)(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/)或或或或NCBINCBI的的的的EntrezEntrez檢索系統(tǒng)檢索系統(tǒng)檢索系統(tǒng)檢索系統(tǒng)(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/)選擇)選擇)選擇)選擇PubMedPubMed鏈接選項(xiàng)或直接在瀏覽器地址欄(鏈接選項(xiàng)或直接在瀏覽器地址欄(鏈接選項(xiàng)或直接在瀏覽器地址欄(鏈接選項(xiàng)或直接在瀏覽器地址欄(URLURL)中輸入中輸入中輸入中輸入“http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fchttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed”gi?db=PubMed”即可進(jìn)入即可進(jìn)入即可進(jìn)入即可進(jìn)入PubMedPubMed檢索界面。檢索界面。檢索界面。檢索界面。PubMedPubMed有多種檢索途徑,有多種檢索途徑,有多種檢索途徑,有多種檢索途徑,包括自由詞、文獻(xiàn)作者、包括自由詞、文獻(xiàn)作者、包括自由詞、文獻(xiàn)作者、包括自由詞、文獻(xiàn)作者、規(guī)范主題詞(規(guī)范主題詞(規(guī)范主題詞(規(guī)范主題詞(MeSHMeSH)、期刊名稱、文獻(xiàn)出版年代、)、期刊名稱、文獻(xiàn)出版年代、)、期刊名稱、文獻(xiàn)出版年代、)、期刊名稱、文獻(xiàn)出版年代、文獻(xiàn)類型、文獻(xiàn)語(yǔ)種、物質(zhì)名稱、記錄入檔日期、文獻(xiàn)類型、文獻(xiàn)語(yǔ)種、物質(zhì)名稱、記錄入檔日期、文獻(xiàn)類型、文獻(xiàn)語(yǔ)種、物質(zhì)名稱、記錄入檔日期、文獻(xiàn)類型、文獻(xiàn)語(yǔ)種、物質(zhì)名稱、記錄入檔日期、文獻(xiàn)出版日期等。文獻(xiàn)出版日期等。文獻(xiàn)出版日期等。文獻(xiàn)出版日期等。既可以單一字段檢索,又可以利既可以單一字段檢索,又可以利既可以單一字段檢索,又可以利既可以單一字段檢索,又可以利用高級(jí)布爾邏輯表達(dá)式多字段組配檢索。用高級(jí)布爾邏輯表達(dá)式多字段組配檢索。用高級(jí)布爾邏輯表達(dá)式多字段組配檢索。用高級(jí)布爾邏輯表達(dá)式多字段組配檢索。檢索時(shí)的心理活動(dòng)檢索時(shí)的心理活動(dòng)檢索時(shí)的心理活動(dòng)檢索時(shí)的心理活動(dòng) 第一階段第一階段 希望檢索的內(nèi)容要全面希望檢索的內(nèi)容要全面 第二階段第二階段 希望檢索的內(nèi)容要精煉希望檢索的內(nèi)容要精煉1 1)自由詞自由詞自由詞自由詞/主題詞途徑檢索主題詞途徑檢索主題詞途徑檢索主題詞途徑檢索(Textword/MeSHTextword/MeSH)所謂的自由詞即與欲檢索信息相關(guān)的任意詞。這所謂的自由詞即與欲檢索信息相關(guān)的任意詞。這所謂的自由詞即與欲檢索信息相關(guān)的任意詞。這所謂的自由詞即與欲檢索信息相關(guān)的任意詞。這些單詞可能出現(xiàn)在些單詞可能出現(xiàn)在些單詞可能出現(xiàn)在些單詞可能出現(xiàn)在MEDLINEMEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)記錄的任何字段中。數(shù)據(jù)庫(kù)記錄的任何字段中。數(shù)據(jù)庫(kù)記錄的任何字段中。數(shù)據(jù)庫(kù)記錄的任何字段中。自由詞一般可限定為文獻(xiàn)題名內(nèi)單詞、文獻(xiàn)摘要內(nèi)單自由詞一般可限定為文獻(xiàn)題名內(nèi)單詞、文獻(xiàn)摘要內(nèi)單自由詞一般可限定為文獻(xiàn)題名內(nèi)單詞、文獻(xiàn)摘要內(nèi)單自由詞一般可限定為文獻(xiàn)題名內(nèi)單詞、文獻(xiàn)摘要內(nèi)單詞。詞。詞。詞。PubMedPubMed檢索非常簡(jiǎn)單,只需在檢索窗口內(nèi)輸入檢檢索非常簡(jiǎn)單,只需在檢索窗口內(nèi)輸入檢檢索非常簡(jiǎn)單,只需在檢索窗口內(nèi)輸入檢檢索非常簡(jiǎn)單,只需在檢索窗口內(nèi)輸入檢索詞,再點(diǎn)擊索詞,再點(diǎn)擊索詞,再點(diǎn)擊索詞,再點(diǎn)擊“Search”Search”按鈕即可進(jìn)入檢索。按鈕即可進(jìn)入檢索。按鈕即可進(jìn)入檢索。按鈕即可進(jìn)入檢索。PubMedPubMed具有智能檢索功能,在檢索時(shí),輸入到具有智能檢索功能,在檢索時(shí),輸入到檢索窗口內(nèi)的檢索詞可是一個(gè)或多個(gè)。當(dāng)只用一檢索窗口內(nèi)的檢索詞可是一個(gè)或多個(gè)。當(dāng)只用一個(gè)檢索詞檢索時(shí),個(gè)檢索詞檢索時(shí),PubMedPubMed除在各不同字段中查除在各不同字段中查找該檢索詞以外,還自動(dòng)將檢索詞轉(zhuǎn)化為相對(duì)應(yīng)找該檢索詞以外,還自動(dòng)將檢索詞轉(zhuǎn)化為相對(duì)應(yīng)的主題詞,同時(shí)也從主題詞的途徑予以檢索。的主題詞,同時(shí)也從主題詞的途徑予以檢索。例如:在檢索窗口內(nèi)輸入例如:在檢索窗口內(nèi)輸入“PKCPKC”,PubMedPubMed則在則在各字段中查詢含有各字段中查詢含有“PKCPKC”的文獻(xiàn)。此外,還利用的文獻(xiàn)。此外,還利用其詞表轉(zhuǎn)換功能自動(dòng)將其詞表轉(zhuǎn)換功能自動(dòng)將“PKCPKC”轉(zhuǎn)換為標(biāo)準(zhǔn)轉(zhuǎn)換為標(biāo)準(zhǔn)MeSHMeSH,即:,即:“protein kinase cprotein kinase c”,并利用,并利用“protein protein kinase ckinase c”從主題途徑進(jìn)行檢索。所執(zhí)行的實(shí)際檢從主題途徑進(jìn)行檢索。所執(zhí)行的實(shí)際檢索式為:索式為:“PKCText word OR protein kinas PKCText word OR protein kinas cMesh TermscMesh Terms”。當(dāng)同時(shí)輸入多個(gè)檢索詞或短語(yǔ)進(jìn)行檢索時(shí),檢索詞當(dāng)同時(shí)輸入多個(gè)檢索詞或短語(yǔ)進(jìn)行檢索時(shí),檢索詞當(dāng)同時(shí)輸入多個(gè)檢索詞或短語(yǔ)進(jìn)行檢索時(shí),檢索詞當(dāng)同時(shí)輸入多個(gè)檢索詞或短語(yǔ)進(jìn)行檢索時(shí),檢索詞之間應(yīng)以空格相隔,如:之間應(yīng)以空格相隔,如:之間應(yīng)以空格相隔,如:之間應(yīng)以空格相隔,如:“vitaminccommonvitaminccommoncold”cold”。(ascorbicacidMeSHTermsOR(ascorbicAllFields(ascorbicacidMeSHTermsOR(ascorbicAllFieldsANDacidAllFields)ORascorbicacidAllFieldsORvitamincAllANDacidAllFields)ORascorbicacidAllFieldsORvitamincAllFields)AND(commoncoldMeSHTermsOR(commonAllFieldsFields)AND(commoncoldMeSHTermsOR(commonAllFieldsANDcoldAllFields)ORcommoncoldAllFields)ANDcoldAllFields)ORcommoncoldAllFields)例如:欲在例如:欲在例如:欲在例如:欲在PubMedPubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索維生素?cái)?shù)據(jù)庫(kù)中檢索維生素?cái)?shù)據(jù)庫(kù)中檢索維生素?cái)?shù)據(jù)庫(kù)中檢索維生素H H方面的文方面的文方面的文方面的文獻(xiàn),則應(yīng)在檢索窗口內(nèi)輸入檢索詞獻(xiàn),則應(yīng)在檢索窗口內(nèi)輸入檢索詞獻(xiàn),則應(yīng)在檢索窗口內(nèi)輸入檢索詞獻(xiàn),則應(yīng)在檢索窗口內(nèi)輸入檢索詞“vitaminh”vitaminh”,點(diǎn),點(diǎn),點(diǎn),點(diǎn)擊搜索按鈕擊搜索按鈕擊搜索按鈕擊搜索按鈕“Search”Search”后,后,后,后,PubMedPubMed則將則將則將則將“vitaminvitaminh”h”自動(dòng)轉(zhuǎn)換為自動(dòng)轉(zhuǎn)換為自動(dòng)轉(zhuǎn)換為自動(dòng)轉(zhuǎn)換為“Biotin”Biotin”(BiotinBiotin為為為為vitaminhvitaminh在在在在MEDLINEMEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)中規(guī)范化的數(shù)據(jù)庫(kù)中規(guī)范化的數(shù)據(jù)庫(kù)中規(guī)范化的數(shù)據(jù)庫(kù)中規(guī)范化的MeSHMeSH)。)。)。)。既將既將既將既將“vitaminh”vitaminh”作為自由詞檢索,同時(shí)也將作為自由詞檢索,同時(shí)也將作為自由詞檢索,同時(shí)也將作為自由詞檢索,同時(shí)也將“Biotin”Biotin”作為作為作為作為主題詞檢索,其實(shí)際檢索式為:主題詞檢索,其實(shí)際檢索式為:主題詞檢索,其實(shí)際檢索式為:主題詞檢索,其實(shí)際檢索式為:biotinMeSHTermsORbiotinMeSHTermsORbiotinAllFieldsORvitaminhAllFieldsbiotinAllFieldsORvitaminhAllFields如查詢不到相匹配的主題詞,則自動(dòng)將各檢索詞之間用如查詢不到相匹配的主題詞,則自動(dòng)將各檢索詞之間用如查詢不到相匹配的主題詞,則自動(dòng)將各檢索詞之間用如查詢不到相匹配的主題詞,則自動(dòng)將各檢索詞之間用“AND”AND”組配連接并檢索同時(shí)含有各檢索詞的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)。用戶組配連接并檢索同時(shí)含有各檢索詞的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)。用戶組配連接并檢索同時(shí)含有各檢索詞的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)。用戶組配連接并檢索同時(shí)含有各檢索詞的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)。用戶可在檢索窗口內(nèi)修改、增刪檢索詞,也可以利用可在檢索窗口內(nèi)修改、增刪檢索詞,也可以利用可在檢索窗口內(nèi)修改、增刪檢索詞,也可以利用可在檢索窗口內(nèi)修改、增刪檢索詞,也可以利用“advanced”advanced”功能將檢索詞限定于具體字段。功能將檢索詞限定于具體字段。功能將檢索詞限定于具體字段。功能將檢索詞限定于具體字段。PubMedPubMed主題詞瀏覽器主題詞瀏覽器Liver cancer作者途徑檢索(作者途徑檢索(AuthorAuthor)利用文獻(xiàn)作者途徑檢索利用文獻(xiàn)作者途徑檢索利用文獻(xiàn)作者途徑檢索利用文獻(xiàn)作者途徑檢索PubMedPubMed時(shí),其作者名字的時(shí),其作者名字的時(shí),其作者名字的時(shí),其作者名字的輸入格式應(yīng)為名在前、姓在后。作者姓用全稱,作輸入格式應(yīng)為名在前、姓在后。作者姓用全稱,作輸入格式應(yīng)為名在前、姓在后。作者姓用全稱,作輸入格式應(yīng)為名在前、姓在后。作者姓用全稱,作者名用名字首字母縮寫形式,而且不用標(biāo)點(diǎn)。者名用名字首字母縮寫形式,而且不用標(biāo)點(diǎn)。者名用名字首字母縮寫形式,而且不用標(biāo)點(diǎn)。者名用名字首字母縮寫形式,而且不用標(biāo)點(diǎn)。PubMedPubMed具有自動(dòng)截詞功能以解決名字的不同縮寫具有自動(dòng)截詞功能以解決名字的不同縮寫具有自動(dòng)截詞功能以解決名字的不同縮寫具有自動(dòng)截詞功能以解決名字的不同縮寫和名稱解釋。和名稱解釋。和名稱解釋。和名稱解釋。1966-19841966-1984年年年年:MEDLINE:MEDLINE不限制作者人數(shù)。不限制作者人數(shù)。不限制作者人數(shù)。不限制作者人數(shù)。1984-19951984-1995年年年年:NLMNLM將將將將文文文文獻(xiàn)獻(xiàn)獻(xiàn)獻(xiàn)作作作作者者者者人人人人數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)限限限限制制制制在在在在1010人人人人,超出超出超出超出1010人的,從第人的,從第人的,從第人的,從第1111位作者起以位作者起以位作者起以位作者起以“etal”etal”代替。代替。代替。代替。1996-19991996-1999年年年年:NLMNLM將將將將作作作作者者者者人人人人數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)限限限限制制制制增增增增加加加加到到到到2525人人人人,超出超出超出超出2525人的,第人的,第人的,第人的,第2626位起以位起以位起以位起以“etal”etal”代替。代替。代替。代替。20002000年以后:年以后:年以后:年以后:NLMNLM列出文獻(xiàn)的全部作者。列出文獻(xiàn)的全部作者。列出文獻(xiàn)的全部作者。列出文獻(xiàn)的全部作者。文獻(xiàn)來(lái)源期刊途徑檢索(文獻(xiàn)來(lái)源期刊途徑檢索(TitleTitle)PubMedPubMed允許利用刊名檢索特定期刊發(fā)表的文獻(xiàn)。允許利用刊名檢索特定期刊發(fā)表的文獻(xiàn)。允許利用刊名檢索特定期刊發(fā)表的文獻(xiàn)。允許利用刊名檢索特定期刊發(fā)表的文獻(xiàn)??瓤梢允强Q,如:刊名既可以是刊名全稱,如:刊名既可以是刊名全稱,如:刊名既可以是刊名全稱,如:MolecularbiologyMolecularbiologyoftheCell,oftheCell,也可以是也可以是也可以是也可以是MEDLINEMEDLINE刊名標(biāo)準(zhǔn)縮寫刊名標(biāo)準(zhǔn)縮寫刊名標(biāo)準(zhǔn)縮寫刊名標(biāo)準(zhǔn)縮寫,如:如:如:如:MolbiolcellMolbiolcell。也可以通過(guò)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)連續(xù)出版物代。也可以通過(guò)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)連續(xù)出版物代。也可以通過(guò)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)連續(xù)出版物代。也可以通過(guò)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)連續(xù)出版物代碼(碼(碼(碼(ISSNISSN)查詢期刊,如:)查詢期刊,如:)查詢期刊,如:)查詢期刊,如:1059-15241059-1524。當(dāng)期刊刊名詞同時(shí)也是當(dāng)期刊刊名詞同時(shí)也是當(dāng)期刊刊名詞同時(shí)也是當(dāng)期刊刊名詞同時(shí)也是MeSHMeSH時(shí),如:時(shí),如:時(shí),如:時(shí),如:GeneTherapyGeneTherapy、CellCell等,等,等,等,PubMedPubMed將這些未限定的詞作為將這些未限定的詞作為將這些未限定的詞作為將這些未限定的詞作為MeSHMeSH來(lái)檢索。來(lái)檢索。來(lái)檢索。來(lái)檢索。要想將這些詞限定在刊名字段檢索,需在刊名后加上刊名要想將這些詞限定在刊名字段檢索,需在刊名后加上刊名要想將這些詞限定在刊名字段檢索,需在刊名后加上刊名要想將這些詞限定在刊名字段檢索,需在刊名后加上刊名標(biāo)識(shí)符標(biāo)識(shí)符標(biāo)識(shí)符標(biāo)識(shí)符“ta”ta”,如:,如:,如:,如:“Genetherapyta”Genetherapyta”。此外,如果。此外,如果。此外,如果。此外,如果刊名為一個(gè)單詞時(shí),將其作為檢索詞檢索時(shí)也應(yīng)利用刊名刊名為一個(gè)單詞時(shí),將其作為檢索詞檢索時(shí)也應(yīng)利用刊名刊名為一個(gè)單詞時(shí),將其作為檢索詞檢索時(shí)也應(yīng)利用刊名刊名為一個(gè)單詞時(shí),將其作為檢索詞檢索時(shí)也應(yīng)利用刊名標(biāo)識(shí)符標(biāo)識(shí)符標(biāo)識(shí)符標(biāo)識(shí)符“ta”ta”加以限定。否則,加以限定。否則,加以限定。否則,加以限定。否則,PubMedPubMed將在所有字段將在所有字段將在所有字段將在所有字段中搜索該單詞。中搜索該單詞。中搜索該單詞。中搜索該單詞。例如:查詢例如:查詢例如:查詢例如:查詢“Contraception”Contraception”時(shí),以不同途徑進(jìn)行時(shí),以不同途徑進(jìn)行時(shí),以不同途徑進(jìn)行時(shí),以不同途徑進(jìn)行檢索可以獲得不同的檢索結(jié)果。限定在刊名字段檢索可以獲得不同的檢索結(jié)果。限定在刊名字段檢索可以獲得不同的檢索結(jié)果。限定在刊名字段檢索可以獲得不同的檢索結(jié)果。限定在刊名字段“Contraceptionta”Contraceptionta”檢索可獲得檢索可獲得檢索可獲得檢索可獲得37583758條文獻(xiàn),條文獻(xiàn),條文獻(xiàn),條文獻(xiàn),未加限定即作為自由詞未加限定即作為自由詞未加限定即作為自由詞未加限定即作為自由詞“contraception”contraception”檢索可獲檢索可獲檢索可獲檢索可獲得得得得3461734617篇文獻(xiàn)。輸入篇文獻(xiàn)。輸入篇文獻(xiàn)。輸入篇文獻(xiàn)。輸入parasiteparasite檢索到檢索到檢索到檢索到124018124018篇,篇,篇,篇,輸入輸入輸入輸入parasitetaparasiteta,檢索到檢索到檢索到檢索到11831183篇。篇。篇。篇。利用利用利用利用ISSNISSN途徑檢索可查詢到絕大多數(shù)期刊,但個(gè)別途徑檢索可查詢到絕大多數(shù)期刊,但個(gè)別途徑檢索可查詢到絕大多數(shù)期刊,但個(gè)別途徑檢索可查詢到絕大多數(shù)期刊,但個(gè)別老刊可能因?yàn)闆](méi)有老刊可能因?yàn)闆](méi)有老刊可能因?yàn)闆](méi)有老刊可能因?yàn)闆](méi)有ISSNISSN而查詢不到。以刊名途徑檢而查詢不到。以刊名途徑檢而查詢不到。以刊名途徑檢而查詢不到。以刊名途徑檢索時(shí),刊名中帶有括號(hào)的可將括號(hào)省略不輸,如:索時(shí),刊名中帶有括號(hào)的可將括號(hào)省略不輸,如:索時(shí),刊名中帶有括號(hào)的可將括號(hào)省略不輸,如:索時(shí),刊名中帶有括號(hào)的可將括號(hào)省略不輸,如:“JHandSurgAmJHandSurgAm”可以應(yīng)用可以應(yīng)用可以應(yīng)用可以應(yīng)用“JHandSurgJHandSurgAmtaAmta”檢索式檢索。檢索式檢索。檢索式檢索。檢索式檢索。查詢查詢查詢查詢PubMedPubMed系統(tǒng)中的具體刊名可通過(guò)系統(tǒng)中的具體刊名可通過(guò)系統(tǒng)中的具體刊名可通過(guò)系統(tǒng)中的具體刊名可通過(guò)PubMedPubMed的的的的“期刊瀏覽器(期刊瀏覽器(期刊瀏覽器(期刊瀏覽器(JournalsinNCBIDatabasesJournalsinNCBIDatabases)”實(shí)現(xiàn)。通過(guò)點(diǎn)擊實(shí)現(xiàn)。通過(guò)點(diǎn)擊實(shí)現(xiàn)。通過(guò)點(diǎn)擊實(shí)現(xiàn)。通過(guò)點(diǎn)擊PubMedPubMed主頁(yè)下面的主頁(yè)下面的主頁(yè)下面的主頁(yè)下面的“JournalsinJournalsinNCBIDatabases”NCBIDatabases”進(jìn)入刊名檢索界面。進(jìn)入刊名檢索界面。進(jìn)入刊名檢索界面。進(jìn)入刊名檢索界面。PubMed PubMed 期刊瀏覽器期刊瀏覽器 網(wǎng)頁(yè)上還提供一個(gè)全文期刊網(wǎng)站鏈接列表(網(wǎng)頁(yè)上還提供一個(gè)全文期刊網(wǎng)站鏈接列表(網(wǎng)頁(yè)上還提供一個(gè)全文期刊網(wǎng)站鏈接列表(網(wǎng)頁(yè)上還提供一個(gè)全文期刊網(wǎng)站鏈接列表(journalsjournalswithlinkstofull-textwebsiteswithlinkstofull-textwebsites),通過(guò)該列表可),通過(guò)該列表可),通過(guò)該列表可),通過(guò)該列表可鏈接到這些期刊的網(wǎng)站上。多數(shù)期刊需付費(fèi)閱讀全文,鏈接到這些期刊的網(wǎng)站上。多數(shù)期刊需付費(fèi)閱讀全文,鏈接到這些期刊的網(wǎng)站上。多數(shù)期刊需付費(fèi)閱讀全文,鏈接到這些期刊的網(wǎng)站上。多數(shù)期刊需付費(fèi)閱讀全文,但部分可免費(fèi)閱讀。如:但部分可免費(fèi)閱讀。如:但部分可免費(fèi)閱讀。如:但部分可免費(fèi)閱讀。如:JournalofBiologicalJournalofBiologicalBiochemistryBiochemistry、JournalofClinicalInvestigationJournalofClinicalInvestigation等。等。等。等。截詞檢索(截詞檢索(TruncationTruncation)在檢索中,將通配符在檢索中,將通配符在檢索中,將通配符在檢索中,將通配符“*”“*”置于檢索單詞或詞根后,即可檢置于檢索單詞或詞根后,即可檢置于檢索單詞或詞根后,即可檢置于檢索單詞或詞根后,即可檢索出含有以此單詞或詞根開(kāi)頭的所有單詞的文獻(xiàn)。如:在檢索出含有以此單詞或詞根開(kāi)頭的所有單詞的文獻(xiàn)。如:在檢索出含有以此單詞或詞根開(kāi)頭的所有單詞的文獻(xiàn)。如:在檢索出含有以此單詞或詞根開(kāi)頭的所有單詞的文獻(xiàn)。如:在檢索窗口內(nèi)輸入:索窗口內(nèi)輸入:索窗口內(nèi)輸入:索窗口內(nèi)輸入:“flavor*”flavor*”,則可自動(dòng)對(duì)以,則可自動(dòng)對(duì)以,則可自動(dòng)對(duì)以,則可自動(dòng)對(duì)以“flavor”flavor”開(kāi)開(kāi)開(kāi)開(kāi)頭所有單詞進(jìn)行檢索,如:頭所有單詞進(jìn)行檢索,如:頭所有單詞進(jìn)行檢索,如:頭所有單詞進(jìn)行檢索,如:flavored,flavorful,flavoringflavored,flavorful,flavoring等,等,等,等,獲得所有含有這些單詞的文獻(xiàn)。最多同時(shí)對(duì)以一個(gè)詞根開(kāi)頭獲得所有含有這些單詞的文獻(xiàn)。最多同時(shí)對(duì)以一個(gè)詞根開(kāi)頭獲得所有含有這些單詞的文獻(xiàn)。最多同時(shí)對(duì)以一個(gè)詞根開(kāi)頭獲得所有含有這些單詞的文獻(xiàn)。最多同時(shí)對(duì)以一個(gè)詞根開(kāi)頭的前的前的前的前150150個(gè)變異名個(gè)變異名個(gè)變異名個(gè)變異名.利用加通配符利用加通配符利用加通配符利用加通配符“*”的詞根只可檢索以此詞根擴(kuò)展的的詞根只可檢索以此詞根擴(kuò)展的的詞根只可檢索以此詞根擴(kuò)展的的詞根只可檢索以此詞根擴(kuò)展的全部單詞,不能檢索以此詞根開(kāi)頭的詞組。如:利用全部單詞,不能檢索以此詞根開(kāi)頭的詞組。如:利用全部單詞,不能檢索以此詞根開(kāi)頭的詞組。如:利用全部單詞,不能檢索以此詞根開(kāi)頭的詞組。如:利用“infection*infection*”只能檢索出只能檢索出只能檢索出只能檢索出“infectionsinfections”,而不能,而不能,而不能,而不能檢索出檢索出檢索出檢索出“infectioncontrolinfectioncontrol”。截詞檢索時(shí)自動(dòng)關(guān)閉。截詞檢索時(shí)自動(dòng)關(guān)閉。截詞檢索時(shí)自動(dòng)關(guān)閉。截詞檢索時(shí)自動(dòng)關(guān)閉詞表匹配轉(zhuǎn)換功能,也不能進(jìn)行詞表匹配轉(zhuǎn)換功能,也不能進(jìn)行詞表匹配轉(zhuǎn)換功能,也不能進(jìn)行詞表匹配轉(zhuǎn)換功能,也不能進(jìn)行MeSHMeSH主題擴(kuò)展檢索。主題擴(kuò)展檢索。主題擴(kuò)展檢索。主題擴(kuò)展檢索。詞組檢索(詞組檢索(詞組檢索(詞組檢索(Phrase SearchingPhrase Searching)詞組檢索即檢索特定的詞組。當(dāng)利用詞組進(jìn)行檢索詞組檢索即檢索特定的詞組。當(dāng)利用詞組進(jìn)行檢索詞組檢索即檢索特定的詞組。當(dāng)利用詞組進(jìn)行檢索詞組檢索即檢索特定的詞組。當(dāng)利用詞組進(jìn)行檢索詞組檢索即檢索特定的詞組。當(dāng)利用詞組進(jìn)行檢索詞組檢索即檢索特定的詞組。當(dāng)利用詞組進(jìn)行檢索時(shí),時(shí),時(shí),時(shí),時(shí),時(shí),PubMed PubMed PubMed 首先查詢系統(tǒng)的詞組索引。如在其首先查詢系統(tǒng)的詞組索引。如在其首先查詢系統(tǒng)的詞組索引。如在其首先查詢系統(tǒng)的詞組索引。如在其首先查詢系統(tǒng)的詞組索引。如在其首先查詢系統(tǒng)的詞組索引。如在其詞組索引表中找到相匹配的詞組,則利用該詞組進(jìn)詞組索引表中找到相匹配的詞組,則利用該詞組進(jìn)詞組索引表中找到相匹配的詞組,則利用該詞組進(jìn)詞組索引表中找到相匹配的詞組,則利用該詞組進(jìn)詞組索引表中找到相匹配的詞組,則利用該詞組進(jìn)詞組索引表中找到相匹配的詞組,則利用該詞組進(jìn)行檢索。當(dāng)在詞組索引表中查找不到,一般來(lái)說(shuō),行檢索。當(dāng)在詞組索引表中查找不到,一般來(lái)說(shuō),行檢索。當(dāng)在詞組索引表中查找不到,一般來(lái)說(shuō),行檢索。當(dāng)在詞組索引表中查找不到,一般來(lái)說(shuō),行檢索。當(dāng)在詞組索引表中查找不到,一般來(lái)說(shuō),行檢索。當(dāng)在詞組索引表中查找不到,一般來(lái)說(shuō),PubMedPubMedPubMed將會(huì)把詞組分成將會(huì)把詞組分成將會(huì)把詞組分成將會(huì)把詞組分成將會(huì)把詞組分成將會(huì)把詞組分成2 2 2個(gè)或多個(gè)單詞,以個(gè)或多個(gè)單詞,以個(gè)或多個(gè)單詞,以個(gè)或多個(gè)單詞,以個(gè)或多個(gè)單詞,以個(gè)或多個(gè)單詞,以“ANDANDAND”相連進(jìn)行組配檢索相連進(jìn)行組配檢索相連進(jìn)行組配檢索相連進(jìn)行組配檢索相連進(jìn)行組配檢索相連進(jìn)行組配檢索。為了強(qiáng)迫系統(tǒng)查詢未收錄到其詞組索引表中的特定為了強(qiáng)迫系統(tǒng)查詢未收錄到其詞組索引表中的特定為了強(qiáng)迫系統(tǒng)查詢未收錄到其詞組索引表中的特定為了強(qiáng)迫系統(tǒng)查詢未收錄到其詞組索引表中的特定為了強(qiáng)迫系統(tǒng)查詢未收錄到其詞組索引表中的特定為了強(qiáng)迫系統(tǒng)查詢未收錄到其詞組索引表中的特定詞組,需將該詞組用雙引號(hào)引上。例如:詞組,需將該詞組用雙引號(hào)引上。例如:詞組,需將該詞組用雙引號(hào)引上。例如:詞組,需將該詞組用雙引號(hào)引上。例如:詞組,需將該詞組用雙引號(hào)引上。例如:詞組,需將該詞組用雙引號(hào)引上。例如:“single single single cellcellcell”。當(dāng)檢索利用雙引號(hào)引上的詞組時(shí),。當(dāng)檢索利用雙引號(hào)引上的詞組時(shí),。當(dāng)檢索利用雙引號(hào)引上的詞組時(shí),。當(dāng)檢索利用雙引號(hào)引上的詞組時(shí),。當(dāng)檢索利用雙引號(hào)引上的詞組時(shí),。當(dāng)檢索利用雙引號(hào)引上的詞組時(shí),PubMedPubMedPubMed將關(guān)閉自動(dòng)詞表匹配轉(zhuǎn)換功能和將關(guān)閉自動(dòng)詞表匹配轉(zhuǎn)換功能和將關(guān)閉自動(dòng)詞表匹配轉(zhuǎn)換功能和將關(guān)閉自動(dòng)詞表匹配轉(zhuǎn)換功能和將關(guān)閉自動(dòng)詞表匹配轉(zhuǎn)換功能和將關(guān)閉自動(dòng)詞表匹配轉(zhuǎn)換功能和MeSHMeSHMeSH主題擴(kuò)展檢主題擴(kuò)展檢主題擴(kuò)展檢主題擴(kuò)展檢主題擴(kuò)展檢主題擴(kuò)展檢索功能索功能索功能索功能索功能索功能。PubMed其它檢索命令其它檢索命令主講教師:趙雨杰主講教師:趙雨杰3 3、其它檢索命令(、其它檢索命令(、其它檢索命令(、其它檢索命令(Additional Additional Search CommandsSearch Commands)1 1)PubMed PubMed 檢索規(guī)則與句法檢索規(guī)則與句法檢索規(guī)則與句法檢索規(guī)則與句法 (Search Rules and Syntax Search Rules and Syntax)運(yùn)運(yùn)運(yùn)運(yùn)運(yùn)運(yùn)用用用用用用布布布布布布爾爾爾爾爾爾邏邏邏邏邏邏輯輯輯輯輯輯運(yùn)運(yùn)運(yùn)運(yùn)運(yùn)運(yùn)算算算算算算檢檢檢檢檢檢索索索索索索PubMedPubMedPubMed數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)據(jù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)庫(kù)時(shí)時(shí)時(shí)時(shí)時(shí)時(shí),需需需需需需應(yīng)應(yīng)應(yīng)應(yīng)應(yīng)應(yīng)用用用用用用運(yùn)運(yùn)運(yùn)運(yùn)運(yùn)運(yùn) 算算算算算算 連連連連連連 接接接接接接 詞詞詞詞詞詞“ANDANDAND”、“OROROR”、“NOTNOTNOT”,如如如如如如:vitamin c OR zincvitamin c OR zincvitamin c OR zinc。布爾邏輯運(yùn)算連接詞的意義布爾邏輯運(yùn)算連接詞的意義布爾邏輯運(yùn)算連接詞的意義布爾邏輯運(yùn)算連接詞的意義:ANDANDAND:同時(shí)包含所連接的檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:同時(shí)包含所連接的檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:同時(shí)包含所連接的檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:同時(shí)包含所連接的檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:同時(shí)包含所連接的檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:同時(shí)包含所連接的檢索詞的文獻(xiàn)記錄。OR OR OR:含有其前后任意一個(gè)檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:含有其前后任意一個(gè)檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:含有其前后任意一個(gè)檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:含有其前后任意一個(gè)檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:含有其前后任意一個(gè)檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:含有其前后任意一個(gè)檢索詞的文獻(xiàn)記錄。NOTNOTNOT:排除所選檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:排除所選檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:排除所選檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:排除所選檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:排除所選檢索詞的文獻(xiàn)記錄。:排除所選檢索詞的文獻(xiàn)記錄。PubMedPubMedPubMed處理布爾邏輯運(yùn)算連接詞的順序是從左到處理布爾邏輯運(yùn)算連接詞的順序是從左到處理布爾邏輯運(yùn)算連接詞的順序是從左到處理布爾邏輯運(yùn)算連接詞的順序是從左到處理布爾邏輯運(yùn)算連接詞的順序是從左到處理布爾邏輯運(yùn)算連接詞的順序是從左到右,也可利用圓括號(hào)來(lái)改變運(yùn)算順序。如:右,也可利用圓括號(hào)來(lái)改變運(yùn)算順序。如:右,也可利用圓括號(hào)來(lái)改變運(yùn)算順序。如:右,也可利用圓括號(hào)來(lái)改變運(yùn)算順序。如:右,也可利用圓括號(hào)來(lái)改變運(yùn)算順序。如:右,也可利用圓括號(hào)來(lái)改變運(yùn)算順序。如:common cold AND(vitamin c OR zinc)common cold AND(vitamin c OR zinc)common cold AND(vitamin c OR zinc)。當(dāng)檢。當(dāng)檢。當(dāng)檢。當(dāng)檢。當(dāng)檢。當(dāng)檢索式中有非限定的詞組,索式中有非限定的詞組,索式中有非限定的詞組,索式中有非限定的詞組,索式中有非限定的詞組,索式中有非限定的詞組,PubMedPubMedPubMed就會(huì)自動(dòng)檢索該就會(huì)自動(dòng)檢索該就會(huì)自動(dòng)檢索該就會(huì)自動(dòng)檢索該就會(huì)自動(dòng)檢索該就會(huì)自動(dòng)檢索該詞組而不是簡(jiǎn)單地將各詞進(jìn)行布爾邏輯組合詞組而不是簡(jiǎn)單地將各詞進(jìn)行布爾邏輯組合詞組而不是簡(jiǎn)單地將各詞進(jìn)行布爾邏輯組合詞組而不是簡(jiǎn)單地將各詞進(jìn)行布爾邏輯組合詞組而不是簡(jiǎn)單地將各詞進(jìn)行布爾邏輯組合詞組而不是簡(jiǎn)單地將各詞進(jìn)行布爾邏輯組合。例如:當(dāng)檢索例如:當(dāng)檢索例如:當(dāng)檢索例如:當(dāng)檢索例如:當(dāng)檢索例如:當(dāng)檢索air bladder fistulaair bladder fistulaair bladder fistula時(shí),時(shí),時(shí),時(shí),時(shí),時(shí),PubMedPubMedPubMed把把把把把把a(bǔ)ir bladderair bladderair bladder當(dāng)作一個(gè)詞組首先進(jìn)行檢索,再與當(dāng)作一個(gè)詞組首先進(jìn)行檢索,再與當(dāng)作一個(gè)詞組首先進(jìn)行檢索,再與當(dāng)作一個(gè)詞組首先進(jìn)行檢索,再與當(dāng)作一個(gè)詞組首先進(jìn)行檢索,再與當(dāng)作一個(gè)詞組首先進(jìn)行檢索,再與fistulafistulafistula組配檢索。如果不想利用這種詞組識(shí)別功能,組配檢索。如果不想利用這種詞組識(shí)別功能,組配檢索。如果不想利用這種詞組識(shí)別功能,組配檢索。如果不想利用這種詞組識(shí)別功能,組配檢索。如果不想利用這種詞組識(shí)別功能,組配檢索。如果不想利用這種詞組識(shí)別功能,而要將各詞分別檢索,則需要在各詞之間利用布爾而要將各詞分別檢索,則需要在各詞之間利用布爾而要將各詞分別檢索,則需要在各詞之間利用布爾而要將各詞分別檢索,則需要在各詞之間利用布爾而要將各詞分別檢索,則需要在各詞之間利用布爾而要將各詞分別檢索,則需要在各詞之間利用布爾邏輯連接符相連,如:邏輯連接符相連,如:邏輯連接符相連,如:邏輯連接符相連,如:邏輯連接符相連,如:邏輯連接符相連,如:air AND bladder AND air AND bladder AND air AND bladder AND fistulafistulafistula。在檢索過(guò)程中隨時(shí)可利用詳細(xì)資料查看按。在檢索過(guò)程中隨時(shí)可利用詳細(xì)資料查看按。在檢索過(guò)程中隨時(shí)可利用詳細(xì)資料查看按。在檢索過(guò)程中隨時(shí)可利用詳細(xì)資料查看按。在檢索過(guò)程中隨時(shí)可利用詳細(xì)資料查看按。在檢索過(guò)程中隨時(shí)可利用詳細(xì)資料查看按鈕(鈕(鈕(鈕(鈕(鈕(DetailsDetailsDetails)查看)查看)查看)查看)查看)查看PubMedPubMedPubMed對(duì)詞組的轉(zhuǎn)換結(jié)果。對(duì)詞組的轉(zhuǎn)換結(jié)果。對(duì)詞組的轉(zhuǎn)換結(jié)果。對(duì)詞組的轉(zhuǎn)換結(jié)果。對(duì)詞組的轉(zhuǎn)換結(jié)果。對(duì)詞組的轉(zhuǎn)換結(jié)果。2 2)檢索字段限定()檢索字段限定()檢索字段限定()檢索字段限定(Search Field Search Field QualificationQualification)檢索詞可以利用檢索詞可以利用檢索詞可以利用檢索詞可以利用檢索詞可以利用檢索詞可以利用PubMedPubMedPubMed檢索字段標(biāo)識(shí)符進(jìn)行限定。檢索字段標(biāo)識(shí)符進(jìn)行限定。檢索字段標(biāo)識(shí)符進(jìn)行限定。檢索字段標(biāo)識(shí)符進(jìn)行限定。檢索字段標(biāo)識(shí)符進(jìn)行限定。檢索字段標(biāo)識(shí)符進(jìn)行限定。在在在在在在 檢檢檢檢檢檢 索索索索索索 詞詞詞詞詞詞 尾尾尾尾尾尾 加加加加加加 上上上上上上 字字字字字字 段段段段段段 限限限限限限 定定定定定定 標(biāo)標(biāo)標(biāo)標(biāo)標(biāo)標(biāo) 識(shí)識(shí)識(shí)識(shí)識(shí)識(shí) 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dp。其月、日部分可不輸,只輸年。其月、日部分可不輸,只輸年。其月、日部分可不輸,只輸年。其月、日部分可不輸,只輸年。其月、日部分可不輸,只輸年。其月、日部分可不輸,只輸年或年月,如:或年月,如:或年月,如:或年月,如:或年月,如:或年月,如:1997 edat 1997 edat 1997 edat 或或或或或或 1997/03 dp1997/03 dp1997/03 dp。輸入。輸入。輸入。輸入。輸入。輸入時(shí)間范圍,應(yīng)在日期中間以冒號(hào)時(shí)間范圍,應(yīng)在日期中間以冒號(hào)時(shí)間范圍,應(yīng)在日期中間以冒號(hào)時(shí)間范圍,應(yīng)在日期中間以冒號(hào)時(shí)間范圍,應(yīng)在日期中間以冒號(hào)時(shí)間范圍,應(yīng)在日期中間以冒號(hào)“:”相連,如:相連,如:相連,如:相連,如:相連,如:相連,如:1993:1995 edat 1993:1995 edat 1993:1995 edat 或或或或或或1997/01:1997/06 edat1997/01:1997/06 edat1997/01:1997/06 edat。4 4)子集)子集)子集)子集(SubsetsSubsets)PubMedPubMedPubMed有有有有有有三三三三三三種種種種種種子子子子子子集集集集集集,分分分分分分別別別別別別為為為為為為期期期期期期刊刊刊刊刊刊、主主主主主主題題題題題題和和和和和和文文文文文文獻(xiàn)獻(xiàn)獻(xiàn)獻(xiàn)獻(xiàn)獻(xiàn)狀狀狀狀狀狀態(tài)。態(tài)。態(tài)。態(tài)。態(tài)。態(tài)。利用期刊子集(利用期刊子集(利用期刊子集(利用期刊子集(利用期刊子集(利用期刊子集(journal subsetsjournal subsetsjournal subsets)檢索可區(qū)分出)檢索可區(qū)分出)檢索可區(qū)分出)檢索可區(qū)分出)檢索可區(qū)分出)檢索可區(qū)分出111111個(gè)不同類別的期刊。個(gè)不同類別的期刊。個(gè)不同類別的期刊。個(gè)不同類別的期刊。個(gè)不同類別的期刊。個(gè)不同類別的期刊。期刊子集代碼期刊子集代碼期刊子集代碼期刊子集代碼 利用期刊子集檢索時(shí)不需用子集標(biāo)識(shí)符限定。例利用期刊子集檢索時(shí)不需用子集標(biāo)識(shí)符限定。例利用期刊子集檢索時(shí)不需用子集標(biāo)識(shí)符限定。例利用期刊子集檢索時(shí)不需用子集標(biāo)識(shí)符限定。例利用期刊子集檢索時(shí)不需用子集標(biāo)識(shí)符限定。例利用期刊子集檢索時(shí)不需用子集標(biāo)識(shí)符限定。例如:如:如:如:如:如:asthma AND jsubsetnasthma AND jsubsetnasthma AND jsubsetn。其中的。其中的。其中的。其中的。其中的。其中的“jsubsetjsubsetjsubset”表示期刊子集,最后的字母表示期刊子集,最后的字母表示期刊子集,最后的字母表示期刊子集,最后的字母表示期刊子集,最后的字母表示期刊子集,最后的字母“n n n”代代代代代代表索引的護(hù)理學(xué)期刊。檢索結(jié)果為表索引的護(hù)理學(xué)期刊。檢索結(jié)果為表索引的護(hù)理學(xué)期刊。檢索結(jié)果為表索引的護(hù)理學(xué)期刊。檢索結(jié)果為表索引的護(hù)理學(xué)期刊。檢索結(jié)果為表索引的護(hù)理學(xué)期刊。檢索結(jié)果為MEDLINEMEDLINEMEDLINE數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)索及的護(hù)理學(xué)期刊中的哮喘方面的文獻(xiàn)。據(jù)庫(kù)索及的護(hù)理學(xué)期刊中的哮喘方面的文獻(xiàn)。據(jù)庫(kù)索及的護(hù)理學(xué)期刊中的哮喘方面的文獻(xiàn)。據(jù)庫(kù)索及的護(hù)理學(xué)期刊中的哮喘方面的文獻(xiàn)。據(jù)庫(kù)索及的護(hù)理學(xué)期刊中的哮喘方面的文獻(xiàn)。據(jù)庫(kù)索及的護(hù)理學(xué)期刊中的哮喘方面的文獻(xiàn)。主題子集包括艾滋?。ㄖ黝}子集包括艾滋病(主題子集包括艾滋?。ㄖ黝}子集包括艾滋?。ㄖ黝}子集包括艾滋?。ㄖ黝}子集包括艾滋?。╝idsaidsaids)、毒理學(xué)()、毒理學(xué)()、毒理學(xué)()、毒理學(xué)()、毒理學(xué)()、毒理學(xué)(toxtoxtox)、)、)、)、)、)、互補(bǔ)醫(yī)學(xué)(互補(bǔ)醫(yī)學(xué)(互補(bǔ)醫(yī)學(xué)(互補(bǔ)醫(yī)學(xué)(互補(bǔ)醫(yī)學(xué)(互補(bǔ)醫(yī)學(xué)(camcamcam)、空間生命科學(xué)()、空間生命科學(xué)()、空間生命科學(xué)()、空間生命科學(xué)()、空間生命科學(xué)()、空間生命科學(xué)(spacespacespace)、生)、生)、生)、生)、生)、生物倫理學(xué)(物倫理學(xué)(物倫理學(xué)(物倫理學(xué)(物倫理學(xué)(物倫理學(xué)(bioethicsbioethicsbioethics)和醫(yī)學(xué)史()和醫(yī)學(xué)史()和醫(yī)學(xué)史()和醫(yī)學(xué)史()和醫(yī)學(xué)史()和醫(yī)學(xué)史(historyhistoryhistory)子)子)子)子)子)子集。主題子集可以從集。主題子集可以從集。主題子集可以從集。主題子集可以從集。主題子集可以從集。主題子集可以從“LimitsLimitsLimits”下拉菜單中選擇或下拉菜單中選擇或下拉菜單中選擇或下拉菜單中選擇或下拉菜單中選擇或下拉
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生物信息學(xué)
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